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공간 전사체와 단일세포 전사체의 도메인 적응에 의한 세포의 공간 조성 추정
배성우
배성우 (서울대학교)
2022 BRIC 세미나 상반기  |  2022.06.08
공간 전사체 방법을 이용한다면 넓은 조직의 영역에서 세포들이 어떻게 분포하고 상호작용을 하는지 총체적으로 이해하는 데에 도움이 되겠습니다. 저희 연구팀에서는 세포의 공간 분포를 추정하는 문제를 전사체 데이터의 도메인 적응으로 해결하고자 하였습니다. 우선, 단일 세포 전사체 데이터에서 세포를 무작위로 골라내 세포 혼합물을 구성하였습니다. 다음으로, 적대적 도메인 적응을 이용하여 세포 혼합물로부터 세포 조성을 추정하는 모델을 공간 전사체에서도 세포 조성을 잘 추정할 수 있도록 변형하였습니다. 학습한 딥러닝 모델(CellDART)을 적용하여 뇌와 폐 조직에서 세포의 공간 조성을 정확하고 빠르게 예측할 수 있었습니다. 제시한 방법을 활용한다면, 조직을 구성하는 여러 세포들의 복잡한 상호작용을 해석하는 데에 있어서 도움이 될 것으로 기대합니다.

공간 전사체, 적대적 도메인 적응, 세포 조성
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