공간 후성전사체 분석을 통한 삼중음성유방암 미세환경상의 암 줄기세포 연구 [Nat. Commun. ]
일시
2022년 8월 2일 (화) 오전 10시 (한국시간)
연사
이충원 (서울대학교)
세미나 개요 단일 염기 RNA 편집과 같은 Epitranscriptomic (후성전사체) 기능은 암의 전사 다양성의 원천이지만 종양 미세 환경에서의 공간적 맥락 측면에서 거의 이해되지 않습니다. 여기에서 우리는 면역형광 염색 조직에서 관심 영역을 분리하고 transcriptomics 및 epitranscriptomics 데이터를 얻는 시퀀싱(Select-seq)으로 transcriptomics에 수렴된 공간 정보가 연결된 epitranscriptomics를 소개합니다. Select-seq를 사용하여 삼중 음성 유방암 환자의 종양 미세 환경과 관련하여 암 줄기 세포 유사 미세환경을 분석합니다. 우리는 alternative splicing 변이체를 식별하고, 침윤 T 세포 및 B 세포의 수용체 서열 분석을 수행하고, 종양 조직 섹션에서 아데노신-이노신 염기 편집을 분석하였습니다. 특히, 삼중음성 유방암 미세환경에서 상이한 암 줄기세포 그룹에 특이적인 아데노신-이노신 에디톰을 소개합니다.
