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학술웨비나 개최완료
LADL : 빛을 이용한 3차원 유전체 (3D genome) 구조와 유전자 발현의 조절[Nat. Methods]
LADL: light-activated dynamic looping for endogenous gene expression control
Nat. Methods, Published 24 June 2019 | https://doi.org/10.1038/s41592-019-0436-5
큰 사이즈의 유전체 (genome)는 작은 세포 안에서 수만 번 접히고 접혀 있고 그 과정 중에 멀리 떨어진 loci 끼리의 interactions이 만들어지게 되는데, 그것을 일반적으로 loop라고 부릅니다. 각 유전체 마다 수많은 loop가 존재하고 그 중엔 유전자 발현과 관련 있을 거라고 알려진 것들도 많이 있습니다만, 아직 그 loop가 어떻게 형성되는지, 그리고 그 관련 유전자의 발현에 loop가 어떤 영향을 주는지에 대한 메커니즘 연구는 아직 많은 부분에서 어려운 점이 많습니다. 본 연구에서는 그러한 어려움을 극복할 수 있는 LADL 이라는 새로운 기술을 소개합니다. LADL은 dCas9과 Arabidopsis에서 기원한 CiBN과 Cryptochrome 2 (CRY2)를 활용한 도구로서, 푸른 빛을 쏘아주게 되면 자기네들끼리 빠르게 결합하는 특징을 이용하여 내가 원하는 loci에 loop를 만들어주는 기술입니다. 본 연구에서는 LADL을 줄기세포의 Klf4와 interact 하는 슈퍼인헨서와 그와 멀리 떨어진 Zfp462의 promoter에 적용하였습니다. 5C를 통해 확인해 본 결과, LADL 줄기세포에 푸른 빛을 쏘아주자 슈퍼인헨서는 기존 Klf4와의 loop에서 벗어나서 >500kb 떨어진 Zfp462의 promoter와 새로운 loop을 이루었습니다. 또한 single molecule RNA FISH를 통해 확인해 본 결과 LADL을 이용해서 슈퍼인헨서와 새로운 loop를 이룬 Zfp462의 발현이 기존에 비해 약 30%정도 더 발현됨을 알 수 있었습니다. LADL은 외부의 약품 없이도 빛을 이용하여 빠른 속도로 3차원 loop 구조를 만들 수 있었으며, 앞으로의 loop 형성과 유전자 발현 등 많은 연구에 큰 도움이 될 것으로 기대합니다.
개최 완료
학술웨비나
일시
2024년 03월 28일 (목) 오후 02시
연사
김정섭(한국뇌연구원, DGIST)
학술웨비나
일시
2024년 03월 27일 (수) 오전 10시
연사
목예진(Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health)
학술웨비나
일시
2024년 03월 25일 (월) 오전 11시
연사
서준배(Iowa State University)
학술웨비나
일시
2024년 03월 22일 (금) 오후 03시
연사
오정주(Delft University of Technology)
학술웨비나
일시
2024년 03월 20일 (수) 오후 03시
연사
이혜윤(German Cancer Research Center (DKFZ))
학술웨비나
일시
2024년 03월 20일 (수) 오전 11시
연사
안주성(고려대학교)
학술웨비나
일시
2024년 03월 14일 (목) 오후 03시
연사
유황찬(전북대학교 의과대학)
학술웨비나
일시
2024년 03월 13일 (수) 오후 02시
연사
김진수(한국원자력의학원, 과학기술연합대학원대학교 KIRAMS 캠퍼스(UST-KIRAMS))
일시
2024년 03월 13일 (수) 오전 10시
연사
권오만(한국생명공학연구원)
학술웨비나
일시
2024년 03월 07일 (목) 오전 11시
연사
윤진희(기초과학연구원)