생명과학분야 학술정보 온라인 세미나!
BRIC은 생명과학분야 연구자들의 학술정보 교류에 적극적으로 참가하실 학술웨비나 발표연사를 모십니다.
학술웨비나 개최완료
CRISPR-BetaBinomial(CB2) 기법을 이용한 CRISPR pooled screen data 분석[Genome Res.]
Beta-binomial modeling of CRISPR pooled screen data identifies target genes with greater sensitivity and fewer false negatives
Genome Res., Published in Advance April 23, 2019 | doi: 10.1101/gr.245571.118
CRISPR/Cas9 유전자 편집 기술은 현재 다양한 분야에 활용되고 있는데, disease pathogenesis나 cellular biology에 대해 연관성 있는 유전자 후보군을 찾기 위한 pooled genetic screen (CRISPR pooled screen)을 위해서도 널리 사용되고 있습니다. 이를 통해 high-throughput의 genetic screen이 가능하게 되었으며, screen의 결과로 next generation sequencing (NGS) data가 생성됩니다. CRISPRBetaBinomial(CB2) 기법은 beta-binomial 분포 기반의 modeling을 통한 유전자 후보군을 선별하는 방법과 sliding window 알고리즘을 이용한 정량화 알고리즘으로 구성된 방법으로, 5개의 essential gene screen data 분석 결과를 이전에 발표된 방법들과 비교했을 때, CB2가 가장 높은 정확도를 보이고, 정량화 부분에서도 기존에 개발된 알고리즘보다 높은 정확도를 보임을 확인할 수 있었습니다. CB2 는 현재 R 프로그래밍 언어의 package로 제공하고 있으며 (https://cran.r-project.org/package=CB2), 프로그래밍이나 데이터 분석에 어려움이 있는 연구자들을 위해서 본 연구팀이 2017년에 개발하고 발표한 CRISPR pooled screen 데이터 분석 cloud-computing framework인 CRISPRcloud (http://crispr.nrihub.org)에서도 사용 가능합니다.
개최 완료
학술웨비나
일시
2024년 03월 28일 (목) 오후 02시
연사
김정섭(한국뇌연구원, DGIST)
학술웨비나
일시
2024년 03월 27일 (수) 오전 10시
연사
목예진(Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health)
학술웨비나
일시
2024년 03월 25일 (월) 오전 11시
연사
서준배(Iowa State University)
학술웨비나
일시
2024년 03월 22일 (금) 오후 03시
연사
오정주(Delft University of Technology)
학술웨비나
일시
2024년 03월 20일 (수) 오후 03시
연사
이혜윤(German Cancer Research Center (DKFZ))
학술웨비나
일시
2024년 03월 20일 (수) 오전 11시
연사
안주성(고려대학교)
학술웨비나
일시
2024년 03월 14일 (목) 오후 03시
연사
유황찬(전북대학교 의과대학)
학술웨비나
일시
2024년 03월 13일 (수) 오후 02시
연사
김진수(한국원자력의학원, 과학기술연합대학원대학교 KIRAMS 캠퍼스(UST-KIRAMS))
일시
2024년 03월 13일 (수) 오전 10시
연사
권오만(한국생명공학연구원)
학술웨비나
일시
2024년 03월 07일 (목) 오전 11시
연사
윤진희(기초과학연구원)