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실험Q&A    47건 정확도순 날짜순
Q. chimeric sequences 제거하는 법 질문드립니다
ncbi에 16s를 등록하려고 하는데 업로드한 fasta 파일에 chimeric sequences가 있다면서 업로드가 안된다고 하더라고요 이걸 해결해야 되는데 방법을 모르겠습니다 어떻게 해야 제거 할수 있죠?
답변 0  |  2019.12.02
Q. sequences에대한조언좀~~
.. 없어서... ㅜㅜ 실험을 하지 못하고 있습니다. GQ1b와 GT1b sequences에 대해서 아시는분은 제발 도움 좀 주세요~~ ...
A.  GQB1 gene의 swiss-prot ID number를 알려드립니다. 현재 4종류 유전자가 등록되어 있네요.. Mouse 유래 UniProtKB/Swiss-Prot P70126 UniProtKB/Swiss-Prot Q64687 Human 유래 UniProtKB/Swiss-Prot O15466 Chimpanzee 유래 UniProtKB/Swiss-Prot P6164 ...
답변 1  |  2008.07.10
Q. accession number 관련 질문 드립니다.
is unable to verify sequence and/or annotation provided by the submitter. Sequences flagged as unverified will not be included in NCBI BLAST databases. If you wish to revise these records, please see: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/update.html for proper ...
A.  서열 정보가 없어서 정확히 무엇이 문제인지 모르겠으나 1. 서열이 너무 짧아 BLAST에서 annotation이 안되거나.. 2. 무슨 선행작업을 하셨는지 모르겠으나 partial sequence에 무엇인가 앞뒤로 tagging을 하셨는 ...
답변 1  |  2016.04.04
Q. cleaved amplified polymorphic sequences (CAPS)
arabidopsis mutant 로 genotyping 시 DNA seq.할때요~ primer를 제작해서 elution을 하잖아요~ 이때 PCR 사용시 CAPS로 돌리는데.... CAPS는 어떤 특징이 있는지 알고 싶어요 논문을 보고 있는데 이해는 되지만 RFLPs와 비 ...
A.  비슷한게 아니라 아주 똑같습니다. RFLP가 제한효소로 잘린 dna를 표지한 탐침으로 찾아내는 거라면, CAPS는 pcr 증폭된 dna 조각을 제한효소로 잘라서 젤에서 uv로 본다는 것만 다릅니다.
답변 1  |  2008.07.19
Q. NCBI GenBank 등록방법을 잘모르겠어요...
translation includes noncoding sequence, such as introns or UTR's If the sequences and/or annotation are incorrect, please resubmit the complete file(s) including the corrected sequences. For additional assistance, please see: https://ncbiinsights.ncbi.nlm.nih ...
A.  것 같습니다. BankIt1982988 : (22) Some or all of the protein coding sequences contain internal stop codons, reading frame shifts (insertions/deletions based on BLAST similarity search results and/or an alignment), and/or have translations that show little ...
답변 1  |  2017.01.19
Q. DNA gyrase B sequence를 sequin으로 NCBI에 등록하려고 합니다.
translation includes noncoding sequence, such as introns or UTR's If the sequences and/or annotation are incorrect, please resubmit the complete file(s) including the corrected sequences. For additional assistance, please see: https://ncbiinsights.ncbi.nlm.nih ...
답변 0  |  2018.04.06
Q. Gnenbank등록시 질문사항
we will replace the current sequences in your submission. However, if the sequences in your submission are correct, please explain the presence of these internal stop codons. Send your reply to: gb-admin@ncbi.nlm.nih.gov Appended for your reference, please ...
A.  중간에 종결코돈이 있다고 하네요. 그부분을 다시 시퀀싱하여 재확인하든지 종결코돈 뒤부분의 염기서열을 제거하든지 해야되겠네요.
답변 2  |  2012.10.22
Q. Blast 결과해석 부탁드립니다.
1514580 Number of extensions: 0 Number of successful extensions: 0 Number of sequences better than 10: 0 Number of HSP''s better than 10 without gapping: 0 Number of HSP''s gapped: 0 Number of HSP''s successfully gapped: 0 Length of query: 961 Length of database: ...
답변 0  |  2007.10.27
Q. CLUSTALW 를 통한 시퀀싱결과에 대한 질문요..
of Pairwise alignments Aligning... Sequences (1:2) Aligned. Score: 61.1455 Sequences (2:2) Aligned. Score: 100 Guide tree file created: [clustalw.dnd] Start of Multiple Alignment There are 1 groups Aligning... Group 1: Sequences: 2 Score:8932 Alignment Score 2461 ...
답변 0  |  2009.04.01
Q. signal peptide cleavage site를 알려주는 SignalP 4.0 Server에 관하여.
Gram-positive bacteria Method Input sequences may include TM regions Input sequences do not include TM regions Graphics No graphics PNG (inline) PNG (inline) and EPS (as links) Output format Standard Short (no graphics) Long All - SignalP-noTM and SignalP-TM ...
답변 0  |  2012.03.08
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