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정확도순 ㅣ 날짜순
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| Q. qRT-pcr protocol 문의. |
| RT-PCR만 해보고, qPCR이나 qRT-PCR은 해본적 없는 학생입니다.
qRT-PCR를 해보려고 셋업을 하고자 하는데,
몇가지 의문이 있어서 문의 드립니다.
1) 보통 qPCR할 때엔, 관심 유전자의 길이가 길더라도,
100-200 ... |
| A. sybr green PCR 하면 1), 2)번에 관해 아무리 들여다 보아도 알 수 없어요.
elongation, denaturation, annealing temp가 적절한지를 점검하는 gradient PCR이 별도로 있고, 그런 PCR은 큐피씨알 하기 전에 전통적인 "젤 베이 ... |
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답변 2 | 2018.04.27 |
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| Q. qRT-PCR 결과가 제대로 나오지 않습니다. |
| primer 사용했을 때 마우스로부터 얻어낸 cell에서는 제대로 qRT-PCR 결과가 나오는 것을 확인했습니다.
여러가지 찾아보았지만 도대체 왜 HUVEC cell과 Raw 264.7 cell의 경우는 제대로 결과가 나오지 않는지 알 ... |
| A. HUVEC cell (https://www.atcc.org/products/all/CRL-1730.aspx)
=> Human cell
Raw 264.7 cell (https://www.atcc.org/products/all/TIB-71.aspx)
=> Mouse cell
일단 프라이머가 세포에서 발현되는 유전자를 정확히 잡는지 NCBI에서 확인해 보시구 ... |
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답변 3 | 2017.06.16 |
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| Q. qRT-PCR과 RT-PCR의 차이점 |
| qRT-PCR(real time PCR)과 RT-PCR(reverse transcription PCR)의 정의와 차이점이 정확히 뭔가요?..
인터넷에 쳐봐도 명확한 답을 얻지 못해서 너무 답답합니다
둘다 mRNA의 양을 확인하기 위한 것이고, RT-PCR은 cDNA를 ... |
| A. 네이버로 검색하지말고
구글에다가 검색하세요.
상세하게 아주 잘 나와있습니다.
좀 더 노력해보세요. |
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답변 3 | 2019.10.06 |
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| Q. 마우스 조직에서 RT-PCR, qRT-PCR primer design 질문하려고 합니다. |
| protein만 보다가 RNA, DNA로 RT-PCR 또는 qPCR, qRT-PCR 하려고 합니다.
조직에 감염된 기생충의 detection을 하고 싶어서 PCR 하려고 하는데요. 주변에서 mouse의 sequence와 제가 보고 싶은 기생충의 sequence 두개를 ... |
| A. 마우스에 조직에서 기생충이 감염된 것을 확인하기 위해서는 그 조직이 마우스가 맞는 것인지, 또 기생충이 감염된 것이 맞는 것인지를 알아야하는데 그러면 마우스의 sequence, 기생충의 sequence 두 개 ... |
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답변 1 | 2020.04.08 |
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| Q. Single blastocyst 샘플을 이용한 qRT-PCR |
| single blastocyst는 cell number가 50개 내외거든요.
그래서 one-step qRT-PCR kit도 고려해봤는데 invitrogen 사이트에 보니 종류가 꽤 많네요.
혹시 one-step kit을 써보신 분 계시면 좀 추천 부탁드립니다.
그리고 다른 ... |
| A. 저희 이효바이오에서 취급하는 Kapa 브랜드의 SYBR kit를 사용해보시는것을 권해드립니다.
Roche 기기 전용 SYBR kit와, Roche 기기 전용의 one-step SYBR kit 모두 제품이 나옵니다.
one-step SYBR kit 사용시, total RNA양 ... |
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답변 2 | 2012.01.04 |
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| Q. qRT-PCR의 GAPDH ct값 |
| 처리하지 않은 배지만을 처리한 (blank)를 이용하여 GAPDH를 qRT-PCR로 측정하였습니다.
(Taqman fast advanced master mix와 taqman gene expression으로하여 ABI 7500을 돌렸습니다. )
결과를 보니 ct값이 17~19사이로 나왔는데 ... |
| A. RNA양이 아주 많은가 보군요, ct 값이 낮으면 낮을 수록 그 유전자의 RNA level이 높다는 뜻입니다.
GAPDH는 항상성을 유지 하는 유전자로써 발현양이 굉장히 높습니다.
그리고 세포마다 ct값이 다르구요, ... |
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답변 3 | 2016.07.14 |
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| Q. Quantitative Gene detect RNA-seq 돌리고 나서 qRT-pcr 돌리는 이유가? |
| Quantitative Gene detect RNA-seq 돌리고 나서 회귀 돌린다음에 유의한 gene들을 알아내고 그 검증과정으로 마지막에 qRT-pcr을 꼭 돌려서 확인하더라구요.
혹시 마지막 검증과정으로 왜 rt-pcr 돌리는지 알려주세요. |
| A.
하지만, 이런 in-silico 기반의 결과가 in-vitro 기반의 qRT-PCR로 까지 똑같은 결과를 나타낸다면
훨씬 데이터의 신뢰도가 높아지므로 항상 실험적으로도 확인 하는 것이 아닐까요 ... |
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답변 1 | 2017.03.10 |
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| Q. qRT-PCR에서 CT값 관련 질문입니다. |
| qRT-PCR 결과 분석할 때
같은 샘플의 CT값 간의 차이가
0.5이하로 되어야 한다고 배웠는데
왜 0.5인지 궁금해서 질문드립니다. |
| A. qRT-PCR 실험 시 Replication 간의 결과 재현성을 Ct 값의 차이로 보는데
여기에 정답은 없다고 생각합니다.
즉, 0.5 정도라고 하는건 알려주신분이 알고 계신 경험적인 기준 일 뿐,
왜 0.5? 라는거에 정확하게 ... |
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답변 1 | 2020.02.13 |
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