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실험Q&A    5,954건 정확도순 날짜순
Q. 16S rDNA sequence 중에서 특이적 primer를 제작하려면
16S ribosomal RNA gene)인 미생물 sequence 중에서 특이적 primer를 제작하려면 어떻게 해야 하나요? 1 agagtttgat cctggctcag attgaacgct ggcggcatgc cttacacatg caagtcgaac 61 ggcagcacgg gagcaatcct ggtggcgagt ggcgaacggg tgagtaatat atcggaacgt 121 ...
A.   일단 20bp정도 사이즈의 55도 정도의 anneal temp을 갖는 primer가 좋습니다. alignment가 이미되어진 file이 RDP에도 제공되어지니 이를 이용해도 되고 ARB에 사용되는 DB를 이용해도 되고 Phydit에 제공되어지는 ...
답변 3  |  2005.09.08
Q. cloning 진행중 primer 문제
restriction emzyme은 프로그램을 통해 BamHI과 XhoI을 선택하였고 primer는 각각 F AT GGATCC ATGGCCAACA Tm 53.7ºC R AGG CTCGAG CTAACTGATGATCT Tm 55.2ºC 이렇게 제작하였습니다. 헌데 자꾸 dimer처럼 100bp 아래쪽에 짙은 밴드만 ...
A.  지금까지 한 것이 아깝긴 할 것입니다만, 미련을 버리시고 바로 더 긴 primer를 합성하시는 것이 좋겠습니다 ...
답변 5  |  2014.08.06
Q. primer제작 조건중..
잘 안가네요. target sequence에 대해 primer를 짤때 sense, antisense primer모두 3번 끝은 target sequence와 상보적인 염기로 하지 않아야 한다는 것인가요? 오히려 상보적이어야 하는거 아닌지요? 이렇게 하는게 ...
A.   즉 두 primer간에 3''-end에서 유사서열이 있어 base paring이 되면 primer dimer가 생성될 수 있다는 의미입니다 ...
답변 2  |  2008.04.19
Q. sequencing primer짤때요
A라는 gene의 sequence를 보려고 하는데요 sequencing primer를 짜려고 합니다. 보려고하는 gene sequenc에서 얼마나 앞에서부터 짜면 되나요? 제가 해본적이 없어서요.. 한~앞뒤로 300bp에서부터 짜면 되나요? ...
A.  잘 읽히지 않은 gene의 후반부를 읽어주면 됩니다. reverse primer로 sequencing을 할 경우 보라색 부분의 gene의 처음부분이 되니까 제대로 읽어줄 수 있습니다 ...
답변 3  |  2012.08.31
Q. primer 짜는데 primer blast와 primer 3
되는 것을 사용해도 잘 되나요?? 그리고 primer 3를 이용하여 primer를 고르면 GC contents는 45-50%로 나오는데, 대신 product size가 대부분이 200bp 근방이더라구요, 저는 priduct size를 400-700사이로 잡고 싶은데, ...
A.  Primer3는 조건별 check-box가 있습니다. 여기서 조건을 바꿔주면 그조건에 따라 유연성있게 primer를 골 ... 처음부터 좋은 primer를 디자인하는 것이 더 편합니다. Primer 디자인 PCR성공의 95%를 좌우합니다 ...
답변 1  |  2012.06.30
Q. primer design좀 도와주세요..
primer를 찾으려고 했는데 GC content값이 넘 높아... 적당한 primer를 찾을수 없다고 나오네요... 그래서 제가 사용하는 ABI 회사에 전화를 했더니.... 다른 program으로 돌려봤더니...taqman으로 하면 tamra도 안되고 ...
A.  합니다. 님께서 보시고 Tm 이 약 60-65 정도 되는 위치에 primer를 선택하심이 좋을듯 하네요 예를 들어 님의 sequence중에 GTA ATC CTT GCT TTT GTC GCC ACG forward로 선택을 하신다면 basic Tm 이 57도, GC content는 50%가 ...
답변 1  |  2006.04.24
Q. primer 주문 제작할때요...
? 제가 primer 주문을할려고하는데요.. synthesis scale을 주로 0.02로 주문해야하는데... size가 좀 크다고 0.05로 주문을 햇습니다.. 여기서 올때 100pmoles/ul로 오는데.. 20pmoles/ul로 만들려고하는데요.. 이때 TE를 ...
A.  0.02 나 0.05나 scale일 뿐입니다. 결론 적으로 말씀드리자면, 100pmol에 대한 volume을 primer tube에 적어서 보내 줍니다. 따라서 기존에 하시던 대로 하시면 될 것 같습니다.
답변 1  |  2015.03.01
Q. primer 이렇게 짜도 되나요?
않을까 싶어서요. 이런부분에 대해 설명돼있는 곳도 없고 primer 주문하는거도 막하기 어려운지라 ㅠㅠ 혹시 이런부분 잘 아시는분 있으면 답변 부탁드립니다!! ...
A.  6개 정도로 이상해지지 않습니다~
답변 2  |  2015.08.31
Q. primer 짜는법
29mer) R : AATCCTGTGGCAGCAG(16mer) 총 product size는 123bp입니다. 위의 primer로 pcr이 제대로 이루어질까요? forward와 reverse의 mer차이가 너무 심하게 나서요. 경험있으신 선생님들 의견좀 주세요. ...
A.  forward와 reverse primer의 mer수에 따라 PCR이 이루어 지거나 이루어지지 않는다거나 판단할 수 없습니다. 구 ... 용도에 맞추어 Tm까지 고려하여 디자인하신다면 이미 primer 디자인을 마스터 하신겁니다 ...
답변 1  |  2015.05.07
Q. isoform까지 잡는 primer
궁금한점이 있어서요... 논문을 보다 보니.. isofrom까지 잡는 primer가 있더라구요... 혹시.. 어떻게 짜는지 아시는 분 계신지... 아님 그렇게 짜 주는 프로그램같은게 상용화되어 있는게 있는지... 안 ...
A.  없어져 B form이 만들어 지는 경우라면 중첩되는 부분에서 primer 를 잡으시면 됩니다. PCR을 돌리면 A form은 300bp, B form은 200bp의 product이 동시에 나오게 됩니다. A form만 있는 cell이라면 당연히 300bp의 PCR ...
답변 1  |  2004.07.27
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