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실험Q&A    3건 정확도순 날짜순
Q. metagenomics를 위한 sample준비 관련해서 궁금한 것이 있습니다..
안녕하세요. metagenomics를 하기위한 sample준비에 있어 궁금한 것이 있어 글을 남기게 되었습니다. 일단 저는 "손"에 어떤 균들이 있는지 알아보기 위한 실험을 하려고합니다 균을 적정 숫자까지 키워서 16s ...
답변 0  |  2019.05.10
Q. Megan program 사용하신분
제가 metagenomics 를 수행해서 얻은 결과를 디스플레이를 하려고 합니다. 원형의 그래프 만으로는 적절치 않아서 마땅한 방법을 찾으려고보니 megan이라는 프로그램을 사용한 논문이 있었습니다. 이에 ...
답변 0  |  2011.12.22
Q. 박테리아 16S 를 이용한 NGS실험에서 대략 몇개의 박테리아가 들어갈까요?
https://www.thermofisher.com/content/dam/LifeTech/Documents/PDFs/Ion-16S-Metagenomics-Kit-ASM-2014-poster-final.pdf 최종 나온 어느 fastq 파일에서 read 개수가 대략 100만개이고, 길이가 너무 짧거나 품질이 좋지 못한것을 필터하면 ...
A.  대변 중 세균의 수가 중요한게 아니라 그 세균의 DNA를 PCR로 증폭한게 문제네요. 증폭한 DNA를 100만개 읽은것은 그만하면 "분석하기에 충분하다"고 판단됐기 때문에 그런것이지 세균의 수가 100만개가 ...
답변 2  |  2018.07.23
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