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실험Q&A    710건 정확도순 날짜순
Q. PAGE gel EMSA (Protein-Protein interaction, data 있음)
수 있겠네요..) 추가) 생각해보면 Super-shift도 protein-protein interaction을 보는 것이고, 종종 쓰이는 실험기법이라, 제가 한 실험도 아무 문제 없을 것이라 생각이 되기도 하네요. upload ...
A.  것입니다. 방금 간단히 구글링해보니 EMSA로 protein-protein interaction을 보는 경우도 있긴 있군요. 하지만 하나의 단백질에 label을 하여 (eg. fluorescent, radiolabeling, etc) 그 labeling의 shift를 readout으로 삼았군요 ...
답변 1  |  2016.07.27
Q. protein-protein interaction 측정 방법
방법을!! 잘 모르겠습니다. 단백질-단백질이 서로 얼만큼의 interaction이 되는지를 data 수치화 시켜..... 비교할 실험 디자인을 어떻게 하면 좋을까요?? 혹~ 알고 계신분이거나... 단순하게라도 아이디어를 ...
A.  합니다. Kd 측정중 가장 간단한 방법은 ELISA based protein interaction 방법입니다. 그런데 이 실험에서 구한 Kd는 실험방법상 정확한 Kd가 아닙니다. (apparent Kd 라고 부릅니다) 정확한 Kd (true Kd이라 부릅니다)를 ...
답변 4  |  2011.02.21
Q. protein-protein interaction 볼 때 IP 계획중에 여쭤볼게잇습니다..ㅎ
들었는데 요것이 사실인지요..? ---------2번 질문.. 그리고,., interaction을 볼 때, mild한 조건, mild mild 하는데,. 너무 mild한 조건으로 실험을 하려다 보니 cell이 잘 안깨질 가능성도 있는지요..? 제가 예전에 좀 ...
A.  뭐 별것도 없습니다. endogenous protein을 IP해서 endogenous interaction partner를 보는거야 조금 까다롭긴 하겠지만, FLAG붙이고 overexpression해서 거기에 딸려오는 단백질 보는건 앞에 IP 과정만 빼면 웨스턴이랑 ...
답변 1  |  2013.10.27
Q. 이종 간의 단백질 interaction이 가능한가요?
때문이 아닐까 라는 것입니다. 이종간의 단백질의 interaction이 가능한지, 그리고 그게 competitor가 될수 있을까요 ...
A.  원래 A와 B에 대한 결합관계를 미리 아시고 실험을 하는것인지 묻고 싶습니다. 단백질의 결합관계를 예상할때 강하게 결합을 할수도 있지만.. 여러가지 버퍼의 조성이나.. 염농도에 의해서 떨어지는 ...
답변 2  |  2008.11.22
Q. 세가지 단백질의 interaction을 보는 방법?
A와 B가 interaction하는데 C가 들어오면서 A나 B에 붙어서 A-B interaction이 사라질 수 있다는 가설 하에 실험을 진행하려고 합니다. 세포내에 3가지를 co-transfection해서 immunoprecipitation을 한 경우는 잘 ...
A.  저라면 각 단백질에 GFP, CFP, YFP tag을 해서 FRET을 보겠습니다.
답변 3  |  2012.10.08
Q. endogenous interaction 잘 보이시나요?
해보고, antibody는 6ug/30ul로 넣는데.. 안잡힙니다 ㅠㅠ endogenous interaction 확인하신분들 어떻게 하셨나요 ...
A.  cytosol에서 direct interaction하는 protein이라면 endo level에서도 기본적인 condition으로 잘 잡힙니다만, 그외의 경우라면 우선 transfection하여 interaction 유무를 먼저 확인하는 것이 좋을 듯 합니다.
답변 3  |  2008.11.10
Q. IP를 통해서 Interaction protein.. 고수님 실험조언부탁합니다.
protein을 찾을수 있을까요? band로 보려면 엄청난 양의 Interaction protein이 필요할꺼 같은데 말이죠.. 실험적 조언 부탁드립니다 ...
A.  단백질은 없는거 같다면 워낙 미끄덩 한 단백질이라서 interaction하는 단백질을 찾기 쉽지 않을겁니다만.. cross linker 시약을 처리하여 결합을 안정적으로 유지시켜 IP를 하는 방법들도 있습니다. ...
답변 1  |  2010.05.03
Q. protein interaction 어디까지 증명해야
-> co-IP로 확인. 현재 여기까지 진행했는데, 이로써 protein interaction한다고 하고 그 다음으로 넘어가면 되는지 아니면 또 증명해야할 것이 있는지요? 그리고, 보통은 His pull-down을 E.coli에서 purify한 ...
A.  purified protein을 binding하는 것을 보여주는 것은 direct binding을 증명하기 위함입니다, 님께서는 이미 Y2H를 하셨기 때문에 direct binding을 보셨다고 생각됩니다. 오로지 binding으로만 논문을 내실 것이 아니시 ...
답변 3  |  2009.12.24
Q. 단백질 간의 interaction을 확인하는 방법에 대해서 ...궁금합니다..
단백질을 직접적으로 섞어서 SDS-PAGE 나 Native gel 상으로 interaction을 확인 하거나, GPC를 이용하는방법...등 위의 방법은 저의 추측입니다... 혹시 정확한 방법을 알고 계시거나, 관련 논문을 알고 ...
A.  가장 일반적인 방법은 BIACORE 라는 장비를 사용하는 것입니다. SPR과 BIACORE를 키워드로 찾아보시면 엄청난 문헌이 있을 겁니다.
답변 3  |  2010.02.09
Q. peptide와 microbial membrane interaction에 대해...
주요한 원인이 있다고 알고 있는데요.. charge와 hydrophobic interaction 이 둘 중 어느 힘이 더 강력하게 작용하나요?? charge가 아마 더 많은 작용을 할것 같은데 혹시 관련된 논문도 좀 가르쳐주시면 ...
A.  않는 것 같습니다. charge가 initial binding에 중요하고 hydrophobic interaction이 membrane disruption에 중요하지만, 그 외에도 상당히 복잡한 요인들이 관련되어 있는 것 같더군요. 더군다나 cyclic peptide가면 분자간 h ...
답변 1  |  2009.02.21
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