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실험Q&A    18건 정확도순 날짜순
Q. Illumina sequencing 을 위한 DNA library 를 준비하는 방법에 대해 질문 드립니다
있는데, mixture 안의 sequence 들의 population 을 분석하기 위해 Illumina sequence 를 하려 합니다. 샘플은 RT-PCR 을 위한 forward primer-target DNA sequence-backward primer 로 구성되어 있고, 모두 같은 길이 (~80 bp) 를 가지고 ...
A.  해당실험을 주기적으로 계속해서 수행 할 예정이다. Sequencing 러닝을 직접 한다. 위 두 경우가 아니라면 직접 Library preparation 하는게 가격도 비싸며 훨씬 비 효율적입니다. 즉 궁금하신 내용들을 ...
답변 1  |  2017.06.20
Q. NGS illumina miseq
안녕하세요 ^^ NGS illumina miseq 분석 어디서 가능하며, 비용은 얼마나 하는지 궁금합니다.
A.  Macrogen, DNA link 와 같은 NGS 서비스 업체에 문의하시고 견적을 받아보시는것을 추천드립니다. 가격은 어떤 라이브러리를 제작 할것이냐, 서열정보를 얼마나 많이 얻을 것이냐에 따라 천차만별 입니다.
답변 2  |  2019.06.03
Q. Illumina genome analyzer를 사용하고 싶은데
sequencing을 하려고 illumina genome analyzer를 사용하려고 합니다 BMS에서 서비스해주는것 같은데 혹시 또 어디서 해주시는지 아시면 답변 좀 부탁드립니다
A.  서울대학교 농생명과학공동기기원(NICEM) 유전체 분석센터에서도 illumina sequencing 서비스를 하고 있습니다.
답변 1  |  2010.06.11
Q. NGS Illumina
최근 저는 M사를 통해 세균의 NGS 의뢰 (Illumina HiSeq 2000 system) 를 하여 reference sequence와 비교하여 다른 SNP, Idel에 관한 정보를 엑셀로 받았습니다. full sequence는 얻지 못했구요, reference와 다른 염기서열 ...
A.  Synonymous/Nonsynonymous SNP의 ratio를 보실거라면 MEGA5를 쓰시면 될 거 같네요. 간단한 얼라인먼트나 트리는 Bioedit 쓰시면 될 거 같구요. 뭐 요즘은 웹베이스로도 웬만한 프로그램들은 돌릴수가 있으니까 구 ...
답변 1  |  2013.01.05
Q. 바이러스염기서열 분석기 구매건
고민이 많습니다. illumina사 꺼는 어떤지요? 그리고 국내illumina 장비 취급하는 업체는 어디인지 알려주시면 감사하겠습니다 ...
답변 0  |  2015.06.13
Q. Microarray 칩에 대한 질문입니다
안녕하세요 두 가지 다른 셀 라인에 대한 gene expression profile을 비교하고자 합니다 Human cell line 이 ... 알아본 것은 Affymetrix의 "GeneChip Human genome u133 plus 2.0" 과 Illumina의 "Human HT-12 v4. Beadchip" 입니다 ...
A.  칩정보란 probe정보를 알고싶은건가요?
답변 1  |  2012.07.17
Q. NGS index primer
안녕하세요. illumina NGS에 대해 처음 공부중인 학생입니다. adapter에 primer binding site와 index sequence 그리고 flow cell hybridization sequence가 있는 것으로 알고있는데. adapter에 index sequence가 존재하는 이유가 ...
A.  보통 NGS 장비에서 얻을 수 있는 데이터의 양이 많기 때문에 한번에 여러개의 샘플을 시퀀싱하는게 가격대비 효율이 높습니다. 그래서 index를 넣고 각각의 시퀀스가 어떤 샘플에서부터 유래되었는지 ...
답변 1  |  2017.02.03
Q. Fosmid Mate Pair library 제작 서비스 업체 아시나요?
library를 제작 시키고, 이걸 다시 시퀀싱 회사로 넘겨서 Illumina 시퀀싱을 하도록 하면 될까요? 이런 회사는 어디가 있을까요? 아시는 분 정보 나눔해 주시면 고맙겠습니다. 모두 활기찬 하루 보내시길 ...
답변 0  |  2018.03.15
Q. NGS 결과 분석: amino acid subsitution을 sorting하려 합니다.
illumina HiSeq2000으로 bacterial whole genome sequencing 후 nucleotide alteration 결과를 excel로 정리하여 받았습니다. 이 nucleotide alteration이 amino acid substitution을 가져오는지를 알고 싶어서 여러 툴들을 찾아보았으나, ...
답변 0  |  2016.01.12
Q. Sheared genomic dna로 pyrosequencing을 이용한 genome sequencing 가능한가요?  |  첨부파일 첨부파일
Pyrosequencing이나 Illumina genome analyzer를 이용해서 bacteria genome sequencing을 하고자 계획 중입니다. 일단 genomic dna를 추출한 상황인데요, 양은 충분하게 나온 듯 한데 추출 과정에서 shearing이 좀 일어났습니다. ...
A.  사진이 안 보입니다. 예전엔 순도가 높아야 되서 문제가 될텐데 요즘엔 지저분해도 잘 된다고 합니다. 배양이 힘들지만 않으면 DNA를 뽑는 게 거의 실험의 전부이니 그 정도는 잘하시는 게 좋습니다. ...
답변 1  |  2010.10.12
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벤치탑 차세대염기서열분석기(Miseq, Illumina)
MiSeq® System | 한국표준과학연구원 | 2013.05.22
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BeadXpress | 국립축산과학원 | 2011.05.30
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