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실험Q&A    15건 정확도순 날짜순
Q. TCGA data portal 사용법에 대하여
있는 guide만으로는 도무지 이해가 가질 않습니다. 혹시 TCGA data의 이용에 대해서 정확하게 알려주실 분 계시는지요. Data의 양이 너무 많다보니 특정 data, 예를 들어서 Methylation, 를 예로들어서 알려주시면 ...
답변 0  |  2013.08.23
Q. TCGA 에서 유전자 발현 자료 분석방법 문의
구합니다. Fileviewpro를 프로그램을 사서 컴퓨터에 설치해서 TCGA에서 찾은 RNAseq 등의 자료를 넣으면 그 중에서 제가 원하는 유전자의 데이타를 얻을 수있는 건가요? 그걸 통계분석하면 되는 건지요? 이 ...
A.  TCGA 다운로드 받은 RNAseq데이터는 엑셀이나 아무 통계프로그램 써도 되는걸로 알고 있습니다. 물론 R 또는 Python 프로그래밍 언어를 배우신다면 더욱 분석범위가 넓어 질꺼구요~
답변 1  |  2016.12.07
Q. TCGA에서 특정 gene RNAseq 얻는 법을 알고 싶어요...
아무리 TCGA에 들어가서 이것저것 눌러보고 구글에 검색해봐도 모르겠어요ㅠㅠ CCLE처럼 나와있으면 좋은데 이건... 어떻게 특정 gene의 RNAseq만 다운하는지 아시는분 계시나요 mutation된 것들 말고 그냥 ...
답변 0  |  2019.07.02
Q. TCGA level1 데이터 받으시는 분 계신가요?
안녕하세요 TCGA에서 데이터를 다운로드 받으려고 하는데요 혹시 level1 데이터를 받으시는분 계신가요 인증과정을 거쳐야 받을 수 있는데 한국 연구자들이 인증을 받을 수 있는지 궁금합니다. 감사합니다.
답변 0  |  2019.02.20
Q. TCGA Exp-gene, Methylation 자료 질문드립니다!
Exp-gene , Methylation level3 data 에서 각 값들이 0을 기준으로 해서 음수 양수 음수일 때 값이 의미하는게 따로 있나요?! Exp-gene같은 경우에는 음수일떄 Downregulation이다 라는것과 같이 말이죠..
답변 0  |  2016.07.12
Q. TCGA에 대해서 물어볼것이 있습니다!!
Tumor matched normal Normal matched Tumor 이 자료의 뜻은 무엇인가요? 암환자에서 정상세포와 암세포를 때어냈다라는건가요?
A.  네.. 그런데 어떤 샘플을 말하는건지 잘 모르겠네요..
답변 2  |  2016.02.11
Q. TCGA자료 혹시 아시는분..ㅠㅠ
Tumor, Matched Normal Tumor, no Matched Normal Normal, Matched Tumor Organ-Specific Control Cell Line Control 한사람 샘플인건 알겠는데... 어떤 샘플인지 자세히 설명해주실분 계신가요?... 암세포인데 일반세포와 맞는다 라는 ...
답변 0  |  2016.02.16
Q. TCGA data
Pan-cancer altas 와 cancer altas는 다른건가요...? 논문에서는 the cancer genomic analysis라고 적어놓고 사이트는 cbiopotal인데 여기에 들어가 보면, Pan-cancer altas data 분석 뿐 입니다,,, 이게 cancer altas 와 같은거 인가요????
답변 0  |  2019.10.15
Q. 각 유전자(혹은 probe)에서 beta-value값이 얼마정도일때 메틸레이션 됐다고 하는건가요?
TCGA에서 methylation 자료를 다운받았는데 기준을 모르겠습니다. level3자료에서 beta값이 얼마 이상일때 이 유전자가 메틸레이션 됐다고 판단할수 있을까요?
답변 0  |  2012.09.27
Q. Mung Bean nuclease에 관해서...
Bean nuclease(MBN) 효소를 이용해서 single strand로 5'' overhang되는 TCGA를 자르려고 합니다. 그런데 takara에서 제공하는 자료에 보면 자를려고 하는 strand 서열이 ApN이나 TpN은 잘 자르지만, CpG 부분은 MBN이 거의 ...
답변 0  |  2007.06.14
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