[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
서비스바로가기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈
검색어 자동완성
실험복 제공
스폰서배너광고 안내  배너1
통합검색
동향
한빛사
Bio일정
VOD
실험
Bio마켓
BioJob
커뮤니티
농수식품
생물종
/
외부협력검색
카테고리  1차  2차
검색범위  
기간설정   ~
실험Q&A    54건 정확도순 날짜순
Q. RNA-seq sample preparations 방법
조직에서 RNA를 추출하여 RNA-seq를 하고 싶습니다. 제가 아는 방법이 맞는건지 궁금하여 글을 남깁니다. sacrifice할때 관류를 하여 장기내의 혈액을 제거하여 주고, 그 후에 RNA LATER에 조직을 적당량을 ...
A.  액체질소에 바로 얼렸는데 추출한 RNA가 분해되었다는 것은 보관이나 샘플링이 아니라 추출의 문제입니다. 그리고 조직의 종류에 따라서 프로토콜이 적합하지 않은 경우가 많습니다. Trouble shooting 문 ...
답변 1  |  2019.02.05
Q. RNA seq 데이터 그리기 (gene therapy 후 transcriptome profile 변화 목적)
안녕하세요.. 돌다돌다 브릭까지 여쭤봅니다. 1) gene therapy 후 대조군과 실험군 모두 RNA seq 보내어 데이터를 받았습니다. 2) 원하는 그림과, scheme은 구상이 되어, 많은 양의 RNA data로부터 실제로 원하는 ...
답변 0  |  2019.09.25
Q. re-seq, RNA-seq, methylaion분석 데이터를 이용한 분석연구관련 질문
re-seq데이터를 통해 프로모터 지역에 SNP를 확인할 계획임 RNA-seq데이터를 통해 시기별 품종별 발현량(gene expression)을 확인하고자 함. methylation분석 데이터를 통해 프로모터 지역에 methylation이 ...
답변 0  |  2015.07.29
Q. RNA-seq에서 enrichment와 transcript abundance
막 공부를 시작한 학부생입니다~ 배경지식이 거의 없어서 RNA-seq관련 논문을 읽는데 어려움이 있어 질문드립니다ㅜㅜ 논문을 읽다가 'enrichment와 transcript abundance의 관계를 알아보기 위해 다음과 같은 ...
답변 0  |  2015.02.06
Q. RNA 분석용 샘플을 원심분리 할시 degradation 많이 될까요?
RNA-seq 분석을 하고자 하는데, 수중 미생물이라, x 2500 g 이상에서 10분 단위로 X10번. 그러니까 100분 이상 원심분리를 돌려 펠렛샘플로 수확을 해야하는 상황입니다. 이때, RNA 샘플의 경우, 분석에 ...
A.  RNA Degradation이 걱정되는경우 샘플 채취 단계부터 Stabilization solution을 쓰시는게 좋을듯 합니다. (http://www.zymoresearch.com/components/dna-rna-shield-2x-concentrate) 상기 제품은 물과 같은 액체 샘플의 DNA/RNA Stabilizing ...
답변 2  |  2017.02.28
Q. RNA-seq DEG 하는데, 실험군에서 소량의 다른 생물의 RNA가 존재한다면?
것으로 예상)가 존재할 것으로 예상되는데요. 이 경우에, RNA-sequncing 후, assembly를 할때.. 소량이라도 영향을 줄 수 있을까요? 예를 들면, Illumina assembly할때 잘못될 가능성이라던지.. 궁금합니다. ...
A.  영향을 줄 수도 있고 안 줄수도 있습니다. 그런데 그 영향을 확실하게 알긴 어려울 것 같고, alignment를 할 때 mismatch의 개수나, read 대비 mismatch의 비율 등을 조금 엄격하게 설정해서 false positive의 개수를 ...
답변 1  |  2017.02.14
Q. 특정 gene knockout된 primary cell의 RNA-seq결과..
gene이 knockout된 마우스(+/-)에서 뽑은 세포에서 RNA를 뽑아 RNA-seq을 해보았습니다. 시퀀싱 결과, 당연히 정상군에 비해 +/-에서 특정 gene A가 낮게 발현될 줄 알았는데, 정상군과 큰 차이가 없는 것을 ...
A.  RNA가 casette가 같이 있는 상태로 transcription되었을 것이고요. RNA-seq에서 쓰였던 probe가 knockout되는 지점의 것을 쓰지 않은 것 같고, QPCR에서 쓰인 프라이머는 knockout된 지점 사이에 PCR product가 생길 경우 ...
답변 2  |  2019.02.08
Q. RNA-Seq DEG 그래프 해석 문제
안녕하세요. RNA-Seq을 분석하려 하는 학부 연구생입니다. upload_image 한 홈페이지 프로그램으로 DEG를 실행시킨 결과인데 gene-est, fitted, final 과 x축 y축이 의미하는 바를 몰라 질문드립니다.
답변 0  |  2019.05.09
Q. Quantitative Gene detect RNA-seq 돌리고 나서 qRT-pcr 돌리는 이유가?
Quantitative Gene detect RNA-seq 돌리고 나서 회귀 돌린다음에 유의한 gene들을 알아내고 그 검증과정으로 마지막에 qRT-pcr을 꼭 돌려서 확인하더라구요. 혹시 마지막 검증과정으로 왜 rt-pcr 돌리는지 알려주세요.
A.  RNA-seq 을 수행한 뒤, 결과를 분석하는 과정에서는 in-silico 기반의 여러가지 분석기법들이 활용 됩니다. 이 과정은 인간이 눈으로 직접 할 수 없고 Assembly, Align 등을 수행 해 주는 프로그램이 해 주는 ...
답변 1  |  2017.03.10
Q. RNA 분리 및 RT-PCR 시 질문 있습니다^^
저는 Trizol method로 RNA를 뽑았구요, 23S 16S 5S rRNA가 band 상에선 잘보이는 상태입니다. 문제는 RT-PCR인데요 저는 RNA seq.를 plasmid에 transformation 후 induction 유무에 따른 RNA 발현양의 차이를 보고 싶습니다. 그 ...
A.  trizol및 chloroform 을 이용해서 RNA 를 불리 했다면... 센트리퓨즈후에 아마 세개의 층으로 불리가 될 것입니다.. 상층의 맑은 층은 RNA 가 있구요... 중간층에 찍꺼기 같이 둥둥 떠 있는 층는 DNA, protein dl 썩 ...
답변 1  |  2008.04.22
오스테오시스
외부협력검색
연구윤리정보센터 검색
ZEUS 활용장비 검색
NDSL(논문/특허/보고서) 검색
한국연구재단(성과/보고서) 검색
e브릭몰 검색
단일세포 RNA 분석 기기(Signle Cell RNA seq System)
모델명 없음 | 연세대학교 의료원 산학협력단 | 2017.08.02
실시간 인기 검색어
western blot 1
pcr 5
cell
cell counting 1
dmso 1
위로가기
생물학연구정보센터(BRIC)  |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
우 37673 경북 포항시 남구 청암로 77 POSTECH 생물학연구정보센터
Copyright © BRIC. All rights reserved  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터   페이스북 페이스북   유튜브 유튜브   RSS서비스 RSS
에펜도르프코리아