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Q. Gel extraction에서 isopropanol 역할 |
다름이 아니라 Gel extraction protocol관련하여 궁금한 ... 질문드립니다.
Quiagen gel extraction kit 쓰고 있는데요,
protocol에 보면 DNA size가 4kb 이상이거나 500bp 아래이면
1 gel vol. of isopropanol을 넣어주면 yield에 ... |
A. DNA가 녹아나오게 하는 역할 입니다.
gel extraction과정중 culonm을 이용하게 되면 DNA가 작은 것들은 culonm에 잘 붙지 못합니다. 작은 DNA일 수록 charge가 약하기 때문에 잘 부착하지 못하는 것인데요
그것으로 ... |
답변 1 | 2014.07.15 |
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Q. Gel extraction 급합니다.. |
36정도 얻고 이걸 다시 gel extraction하면 적어도 20마이크로 ... 로스가 많아서요..
제 gel extraction 방법은요.,
1. 젤 무게당 QC 버퍼를 3배정도 넣고 50도에서 10분간 충분히 흔들어서 녹입니다.
2. 다음 젤 ... |
A. column의 capacity도 고려하여야 합니다.
Gel extraction kit에 보면 loss가 거의 없다라고하지만 어느정도의 loss는 고려하셔야합니다 ... |
답변 4 | 2005.08.26 |
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Q. gel extraction 문제 | 첨부파일 |
같은 결과가 나옵니다. gel extraction kit가 문제가 있나해서 ... 똑같네요.
PCR결과와 gel extraction 후 결과를 첨부합니다.
선배님들의 의견 부탁드립니다.
size는 2kbp 정도 됩니다 ... |
A. 없습니다.
이런 젤 사진은 있으나 마나입니다.
젤 extraction과정은 kit에서 설명한 대로 하셨겠죠?
특히 gel조각의 무게와 solubilization 용액의 비율은 잘 맞추셨겠죠?
사진을 보면 DNA 밴드의 두께가 굉장히 ... |
답변 6 | 2012.01.09 |
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Q. gel extraction 수율이 너무 낮습니다. |
떨어져 고민입니다.
gel extraction kit을 이용해 ... gel에 전기영동실시.
gel extraction kit에서 제공하는 protocol대로 진행
최종 남는 DNA양은 20 ... |
A. 잘렸나요?)
전기영동 결과가 같다는 전제 하에, gel extraction 단계에서,
같은 버퍼, 시약, 키트를 사용했는데 본인의 수율만 낮게 나온다면
실험기구 조작에 따른 개인 편차라고 봐야겠지요.
그런데 ... |
답변 3 | 2016.05.24 |
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Q. gel extraction 시 문제.. |
처리하지 않은 DNA)를 gel-extraction한후 DNA를 확인 하기 ... 않습니다. 물론 control로 gel-extraction하기 전의 DNA를 transformation 하였을 때는 colony가 많이 자라구요..
Qia-EXⅡ Kit를 사용해 보았지만 결과는 ... |
A. 일반적인 방법으로 추출정제하기엔 너무 큰 사이즈입니다. 게다가 과정중에 물리적으로 잘리기 쉽고요.
QuiaEx2 프로토콜에 긴 것을 추출할때 주의사항이 있습니다. 이것도 50kb 이상에서 잘 뽑혀나올지 ... |
답변 2 | 2014.07.01 |
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Q. ligation을 위한 gel extraction.. |
저는 cloning을 배우고 있는 대학원생입니다
주변에 도와주는 선배가 없어서 혼자 끙끙대다가 질문합니다
먼 ...
이렇게 gel extraction 시킨후에 260nm에서 OD ... . 문제점, 조언, gel extraction tip, ligation tip ... |
A. 사용한 insert의 양이 적군요.
gel extraction의 경우 조금은 차이가 있습니다만 수율이 약 90%정도는 될 겁니다.
insert를 더 많이 준비하고 마지막에 insert를 녹이는 과정에서 최대한 농도가 높도록 하는 것이 ... |
답변 2 | 2012.05.30 |
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Q. gel extraction 시.... |
gel extraction 할 때 최소한으로 ... ligation를 하기 위해 gel extraction 을 하려하는데 어느 정도의 DNA를 loading 해서 전기영동 한 것을 gel extraction해야하는 궁금합니다...
그리고 agarose gel electrophoresis 한 밴드를 ... |
A. 없어서 extraction할때 50%를 날린다고 가정하고, ligation할때 100-500ng 사용한다고 계산하면 최소 1ug의 band가 gel에 있으면 되겠네요.
단, 그 DNA가 plasmid에 있는걸 얻는거라면, 만일 plasmid의 크기가 4kb이고 ... |
답변 1 | 2009.03.16 |
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Q. Gel extraction kit으로 extraction 할 때 plasmid가 잘릴 수도 있나요? |
Qiaz*n 사의 Gel extraction kit를 이용하여 cloning 할 insert를 agarose gel에서 extraction하였습니다.
ligation 전에 vector와 insert의 농도를 비교하고자 다시 agarose gel 에 전기영동을 걸어서 확인해 보니, 오른쪽 그림과 ... |
A. 경험상 gel extraction kit를 사용하였을때 plasmid가 잘린적이 한번도 없었습니다.
gel ex.는 protocol 대로만 진행하면 어렵지 않은 실험입니다.
제 생각으론 lab에서 같이 쓰는경우 EB에 문제가 있는 경우를 몇번 ... |
답변 2 | 2015.06.03 |
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Q. gel extraction이 너무 안나와서요.. 알려주세요 |
kit중에 QIAEX II Gel Extraction Kit 말고 QIAquick Gel Extraction Kit 도 있던데
이둘의 차이가 먼지 알려주세요.. 그리고 어떤게 더 낳을지도요..
빨리 추출이 되어야 해서요...
알려주시면 감사하겠습니다... |
A. 플라스미드 DNA 밴드는 약 4.3kb 정도되고요...
이것을 잘라서 나머지는 kit에 따라서 하고 있어요 |
답변 4 | 2009.08.19 |
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Q. Gel extraction 과정에서 원하는 size의 band를 자르고 1.5ml tube에 넣으면 파란색이 생겨요.. | 첨부파일 |
현재 Dokdo-Prep Gel Extraction Kit (spin type)를 이용하여 ... 파란색으로 보이고 Gel extraction buffer를 첨가하면 mixture가 파란색으로 보입니다.. Gel extraction이 끝나고 purified PCR product를 loading하면 너무 수율이 ... |
A. loading dye 색인것 같은데 추출 수율하고는 관계없습니다.
추출 방법적인 문제 일 것 같습니다.
현재 사용하는 kit는 95% 이상 band 회수 가능합니다. |
답변 4 | 2020.06.27 |
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