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정확도순 ㅣ 날짜순
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| Q. DNA-protein binding inhibitor |
| 저해하는건지, 아님 다른 DNA와 protein의 binding에도 inhibition 작용을 하는지 알아보고 싶은데요.
어떤 방법으로 실험을 하는게 가장 효율적일지 생각중인데 잘 모르겠어서요.
논문이나 적절한 실험을 ... |
| A. DNA와 protein의 binding은 EMSA를 이용해 많이 보곤합니다.
하지만 동위원소를 사용한다는 부담도 있고 해서 질문하신 분이 사용할만한 여건이 되는지는 잘 모르겠네요
한번 EMSA에 대한 protocol이나 원리를 ... |
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답변 2 | 2009.01.28 |
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| Q. Protein-DNA binding prediction program |
| 단백질이 있는데, 이 단백질의 protein family 에 6개의 단백질이 ... 이렇게 짧은 부분을 가지고 DNA binding 이 가능한지 알아 볼 수 있는 사이트 혹은 프로그램이 있을까요 ... |
| A. web server가 몇군데 있습니다.
그중 한군데는 DP-Bind: a web server for sequence-based prediction of DNA binding residues in DNA binding proteins (albany.edu)입니다.
예측하더라도 실험으로 확인하는것이 좋습니다. |
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답변 1 | 2020.12.28 |
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| Q. DNA binding protein 에 관해서 질문 드립니다. |
| 궁금합니다.
(다른 분은 DNA binding protein이 전사가 필요없는 부분을 막게 되어서 splicing 된 mRNA를 합성한다는 논리를 펼치셨는데 이것이 맞은건지 틀린건지 또한 부탁드립니다. ... |
| A. 맞긴하지만 더 정확히 하면 transcription factor들이 promotor에 binding하는것을 돕는것이 더 직접적이여서 그런거 아닐까요? 그 후 TF들에 의해 RNA중합효소의 binding이 용이해져 전사가 이루어지니까요.
걍 ... |
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답변 1 | 2009.04.28 |
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| Q. DNA의 seq만 알때 DNA와 binding하는 protein을 찾는 실험이 있나요? |
| Antibody가 필요한데, 반대로 DNA sequence를 알때 여기에 binding하는 protein을 알아내는 실험은 뭐가 있나요?
예를 들어 promoter로 예상되는 부분이 있고 어떤 모르는 Transcription factor가 붙었을때 이 protein이 뭔지 ... |
| A. DNA pulldown assay 후 WB와 MS/MS 분석하면 어떤 단백질인지 알수 있습니다.
염기 서열이 아닌 실제 실험을 해야지 정확히 알수 있습니다. |
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답변 1 | 2021.12.01 |
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| Q. 특정 Protein domain 이 DNA 의 어떤 sequence에 binding 하는지 알 수 있는 방법이 있을까요?? |
| 제가 Target 하는 Protein 이 DNA에 binding 하여 작용 하는 역할을 하는데, 이 Protein 이 어떤 sequence에 specific하게 binding 하는지 알고 싶습니다. 혹시 알 수 있는 방법이 있을까요??... 선배님들 도와주세요! ... |
| A. 일단 타겟 단백질이 전사인자 혹은 regulator일 가능성이 높겠네요,
Chip assay를 해보시면 될 것 같습니다. Chip assay 후 binding site confirm은 luciferase로 하면 되겠네요. |
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답변 1 | 2015.10.20 |
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| Q. DNA binding protein purification |
| 하는데요
논문들을 찾아보니까 DNA binding protein purification Kit가 있더라구요
그래서 여러 회사의 제품들을 알아봤는데 magnetic이 코팅된 biotin을 DNA fragment 에
붙여서 streptavidin으로 땡겨서 identify 하는 ... |
| A. 하기에는 무리가 있으므로 구매하는 것이 바람직합니다).
DNA조각은 biotin이 붙어 있는 primer를 주문하여 PCR하여 바로 사용할 수도 있으며, PCR과정에서 biotin이 붙어 있는 nucleotide를 기질로 이용해 PCR을 할 ... |
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답변 1 | 2010.01.25 |
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Q. ssb protein이 DNA와 binding하는 원리가..? |  첨부파일 |
| 다시 dsDNA가 안되게 막는 SSB Protein (Single strand binding Protein)의 sequencing 구조인데,
DNA와 선택적으로 binding을 이루는 원리가 무엇인가요??
대부분은 uncharged amino acids로 이루어져 있는 것 같고..
Sequencing ... |
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답변 0 | 2014.11.03 |
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| Q. DNA binding protein screening |
| 0bp enhnacer에 interaction하는지 찾고 싶습니다.
요즘 DNA fragment에 biotin을 붙여서 immunoprecipitation한 후에 protein을 찾는 실험이 많이 실행되고 있는 것 같은데여.. 이런 최신식 실험 말고.. 오래전 부터 많이 ... |
| A. Yeast one-hybrid
DNA-Protein interaction 을 알아보고, 그 protein 을 분석하면 될 것 같습니다. |
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답변 1 | 2008.08.16 |
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| Q. Protein binding site를 찾고 있습니다. 방법 좀 알려주세요 |
| host DNA에서 protein의 binding site를 찾는 실험을 하고 있습니다.
이미 알려진 protein이 아니라서 프로그램이나 사이트에서 검색은 안되구요
여러가지 알아봤지만...방법이 마땅치 않네요
제가 시도해본 ... |
| A. 도움이될지 모르지만 참고하십시오
http://www.dojindo.com/newsletter/review_vol3-2.html |
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답변 1 | 2004.08.06 |
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