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실험Q&A    7건 정확도순 날짜순
Q. 2D database 검색
안녕하세요. 2D분석을 의뢰하기전에, 노화와 관련된 2D 결과들을 검색할 수 있는 database가 구축된 홈페이지가 있는지 궁금합니다.
답변 0  |  2008.11.10
Q. 2D에서의 spot의 pI 값은 어떻게 확인할 수 있을까요?
pI 5-8 짜리 strip을 써서 2D 전기영동을 내렸습니다. spot의 분자량은 전기 영동시 marker를 같이 내려서 알 수 있는데 x축의 pI값은 어떻게 확인할 수 있을까요? 답변해 주시면 정말정말 감사하겠습니다.
A.  Isoelectrofocusing marker가 따로 있습니다. Size가 다르지만 pI값을 알고 있는 일부 native protein들을 첨 ... pI값을 추정할 수 있습니다. 그냥 단백질만 걸어서는 기존의 database와 비교하는 수밖에는 없습니다 ...
답변 2  |  2008.01.26
Q. 2-D analysis
mouse brain을 가지고 2-D를 수행하였습니다.. 여러가지 spot을 볼 수 있는데요.. 혹시 이 spot만으로 어떤 protein인지 알 수 있을 만한 정보가 없을까요?? 중요한 spot은 예를 들어 marker처럼 사용할 수도 있을꺼 ...
A.  안녕하세요? 웹을 뒤져보시면 굉장히 많은 database들을 찾을 수 있습니다. 그 중에 대표적인 곳이 http://kr.expasy.org/ch2d/ 입니다. 참고하세요. 이만.
답변 2  |  2003.09.24
Q. PMF와 N 말단 서열 분석 차이
SDS-PAGE나 Native-PAGE로 전기영동하여 나온 band의 단백질이 타겟 단백질인지 확인하기 위해 분석을 맡기고 싶은데요, PMF방법과 N 말단 서열 분석 방법으로 나뉘더라구요.. N 말단 서열분석은 N말단에 있는 ...
A.  전체 단백질 서열을 얻을 수 있고 이것을 blast 같은 database에서 identification하면 됩니다. 장비와 기술이 부족하던 예전에는 N-term분석을 주로 했지만 요즘에는 MS/MS 분석 또는 cloning하여 전체 아미노산 ...
답변 4  |  2021.10.13
Q. machinelearning으로 SARS-CoV-2 antibody structure 만드는 방법?
고3 올라가는 학생입니다! SARS-CoV-2 antibody의 구조와 아미노산 서열을 machinelearning으로 알아내보고자 합니다. 대학 석박사님들께서 하고 계실만큼 난이도가 높다는 것은 압니다 ㅠ 그래도 하는 데 까지 ...
A.  corona virus의 spike 단백질의 3차 구조는 알려져 있습니다(아래 첨부). spike와 항체 결합 부위라는 표현 보다 spike 단백질로 만든 항체의 Fab 구조라는 뜻이 적합합니다. 몇개의 지식으로 하기 쉽지 않을 겁 ...
답변 4  |  2020.03.04
Q. 2DE결과 스캔한 내용 DATABASE 있나요?
열심히시군요. 진짜 존경스럽습니다. 2DE을 하고 있는 학생이데요. 2DE결과인 gel만을 가지고 스캔한 내용을 데이터 ... 너무 궁금해서요.있으면 좀 알려주세요. 2DE초보자 몇달째 실험을 망치고 있네요. ...
A.  //www.expasy.org/ch2d/2d-index.html 에 가셔서 찾아보시면 되구요~ google등에서 검색하셔도 됩니다. 혹 저널을 찾아보시는 것도 좋구요... 몰라서 그렇지 찾아보시면, 많은 것들이 2-DE map으로 실험되 있습니다. ...
답변 1  |  2005.06.24
Q. 2de reference gel image요~
2DE 실험을 하고 있는데.. 제 실험결과로 나온 gel이 ... 잘못 생각하고 있는건가 해서요... 혹시 gel image와 database search가 가능한 사이트를 알고 계시다면 알려주세요 ...
A.  2DE의 경우 실험실에서 셋팅한 결과와 다른 곳과의 비교는 매우 조심스럽게 ... 실험자에 따라 다를 수 있습니다. 그리고, 가능하면 control과 함께 2D를 하셔서 비교하시고 차이가 나는 spot은 MALDI. ...
답변 2  |  2008.08.06
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