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실험Q&A    161건 정확도순 날짜순
Q. 16S rRNA vs DNA??
차이가 무엇인지요? 16S rRNA가 rDNA로 전사되는 ... 추출한 후에 RT를 하고 16S rRNA를 target으로 Real Time PCR을 하면 Bacterial RNA가 정량할 수 있을까요?? 뭔가 기본적인 부분을 제가 모르고 있다는 느낌이 들어서 ...
A.  16S rRNA가 타겟이 아니라 16S rRNA 유전자가 타겟입니다. ii ... 유전자를 PCR 한겁니다. 16S rRNA 유전자는 모든 세균에 다 존재하며 universal primer로 모든 세균의 16S rRNA 유전자를 다 detect할 수 있습니다. ...
답변 2  |  2010.09.01
Q. 16S rRNA에 관하여
터질꺼 같습니다. 16S rRNA를 이용한 primer design에 ... PCR을 하고싶은데 16S rRNA를 이용한 primer를 사용했을때, 분리동정이 되지 않을 꺼 같아서요. 전문가 분들에게 조언을 구하고 싶습니다 ...
A.  추가적으로 말씀드리면 Bacillus cereus group은 16s rRNA 염기서열로 구분 못합니다
답변 3  |  2019.01.23
Q. 16S rRNA 시퀀싱 결과 해석 방법
안녕하세요. 16S rRNA 시퀀싱 결과를 해석하는 ... 위해 분석기관에 16S rRNA 시퀀싱 분석을 의뢰하였고, NBCI의 Blast통해 genebank database 중 어느것과 일치하는지까지 결과를 받았습니다. 그러나 문제는 ...
A.  큐레이션된 database가 있는 데요...greenenegens, silva, chunlab-ez taxon등... 쉽게 chunlab eztaxon검색하셔서 한번 해보세요.
답변 2  |  2017.12.28
Q. 16S rRNA BLAST
미생물의 16S rRNA 서열을 BLAST를 이용해서 얻어내고자 합니다. 우선 BLAST에서 미생물(NC_002505.1)을 입력하고 Database : rRNA/ITS databases + 16S ribosomal RNA sequences 를 선택한 뒤에 Organism에 해당 미생물(Vibrio cholerae ...
A.  확인해보니 1M가 넘는 크기인데요, 이것을 수백bp길이의 16S db에서 검색한다면 이 큰 덩어리의 어느 부분이 ... 예를 들면 이런 식으로 접근할 수 있습니다. 아무 Vibrio의 16S 서열을 하나 사용해서 16S ...
답변 2  |  2020.06.30
Q. 16s rRNA 질문입니다..너무 답답하네요
전 교수님이 16s rRNA를 통해 bacterial ... 이해가 가지 않습니다. 16s rRNA는 종마다 보존되어 있다고 하는데, 어떻게 보존된 것을 가지고 서로 다른 종 간에 구별을 하는 건가요? 이게 같은 종 사이에는 ...
A.  일반적으로 16s rRNA가 구조적으로 유지되는 부분이 있고, 변화되는 부분이 있습니다. 아직 동정되지 않은 균주의 경우 구조적으로 유지되는 conserved region에서 forward & reverse primer를 잡죠. 물론 그 ...
답변 1  |  2007.10.23
Q. 16s rRNA 염기서열 분석관련 질문드립니다.
나타날 경우 이것도 16s rRNA 염기서열 alignment에 ... 건가요? 두번째는 16s rRNA 염기서열을 분석하는 과정에서 27f와 518r의 특정부위가 중복된 peak 이 뜨는데... 그 두 시그널이 서로 다른 높이를 보입니다. ...
A.  F/R primer에서 증촉되는 부분을 확인하기 위하여 그 바깥쪽의 부분을 primer로 만들었기 때문에 읽혀진 부분만 비교해도 동정하는데 문제는 없습니다. 그리고 염기서열 분석 시 각 염기의 시그널의 높이 ...
답변 5  |  2019.01.22
Q. 16S rRNA- Real Time PCR
정량하기위해 16S rRNA을 타겟으로 Real Time PCR을 ... iv) product가 16S rRNA이기 때문에 가능한건 가요?? 개념이 잘 서지 않습니다.ㅠ;; 결) Real Time이 conventional PCR에비해 더 sensitive하기 때문에 저 또한 bacteria를 ...
A.   RNA를 추출하면 16S rRNA가 포함되어 있을테고 1 ... 정확히는 모르겠지만 16S rRNA의 DNA 시퀀스이기 때문에 genomic DNA라고 되어 있는 게 아닐까요. 그게 그거일수도 있지만 시퀀스 올린 사람들이 RT 안하고 ...
답변 2  |  2010.01.21
Q. 16S rRNA- Real Time PCR
정량하기위해 16S rRNA을 타겟으로 Real Time PCR을 ... iv) product가 16S rRNA이기 때문에 가능한건 가요?? 개념이 잘 서지 않습니다.ㅠ;; 결) Real Time이 conventional PCR에비해 더 sensitive하기 때문에 저 또한 bacteria를 ...
답변 0  |  2010.01.18
Q. 16S rRNA
) 16s rRNA를 분석하는건데 왜 DNA를 ... DNA가 전사되서 16s rRNA로 바뀌고 그걸 시퀀싱하는가요? 2) PCR를 하고 cycle sequencing을 하던데 pcr은 DNA수를 증폭하는거인데 cycle sequencing은 pcr를 이용한 sequencing을 ...
A.  말하는 실험은 16s rRNA gene 시퀀싱을 짧게 ... 시퀀싱 하지만 짧게 16s rRNA 시퀀싱이라고 부르죠 그리고 시퀀싱의 정확도를 높이기 위해서는 내 타켓 DNA가 깨끗하게 있을때 잘되기 때문에 PCR로 target DNA를 ...
답변 2  |  2018.11.16
Q. 16S rRNA의 이차구조  |  첨부파일 첨부파일
Sphingomonas chungbukensis DJ77의 16S rRNA 염기서열과 이차구조>라는 논문을 참고로 16S rRNA의 이차구조를 알아보고자 합니다. 논문에서는 Sphingomonas chungbukensis strain DJ77 16S ribosomal RNA gene(https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...
A.   논문에 나오는 16S rRNA 2차 구조는 처음 분석된 ... 거의 conserved 되어있고 16S rRNA 염기서열도 그러하기 때문에 Spingomonas나 대장균이나 거의 2차 구조가 일정하게 유지됩니다. 만일 보고서 같은데에 사용할 ...
답변 1  |  2020.07.23
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6890N | 국립식량과학원 | 2001.11.05
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MicroSEQ Rapid ID System | (재)경북바이오산업연구원 | 2013.05.30
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