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실험Q&A    506건 정확도순 날짜순
Q. 단백질 발현시 시퀀싱
. 중간에 M이 있어서... 검색을 하다보니 어떤분 c-mic human 시퀀싱에도 atg가 중간 중간에 들어가 있던데.. 제가 생각을 하기에는 첫 타타박스 바로 뒤에 나오는 M만 인식을 해서 단백질 발현이 첫 타타박스 ...
A.  AUG가 있다고 무조건 ribosome이 와서 붙는게 아닙니다. Shine-Dalgarno sequence로 검색해 보세요.
답변 2  |  2015.07.28
Q. 시퀀싱젤에서 밴드가 휘는 현상...
약 22~25도 정도 되고 2000V로 하고 있습니다. 요사이는 시퀀싱gel 잘 안거시겠지만 혹시 경험있으시 분의 조언을 부탁드립니다. 전기영동 장치가 잘 못되서 이런 일이 일어날 수도 있는건가요..? 아시는 ...
A.  dye만 보고 밴드가 휜다고 할 수는 없습니다. 일반적으로 러닝이 끝나고 확인해보면 밴드는 제대로 내려간것이 확인됩니다. running 이 끝나고 나서도 밴드가 휘는거라면 전압으로 running하지 마시고 전 ...
답변 1  |  2006.02.13
Q. 시퀀싱
시퀀싱 엄청 잘하는 곳 추천좀 해주세요. 이왕이면 직접 와서 샘플을 가져가주는 곳으로....... (이곳은 수원입니다) 부탁드립니다~
A.  샘플수거해가고... 결과 trimming해서 원하는 값이 안나오면... 금액청구되지 않습니다.... 결과도 잘 나오는 편입니다. 저도 사용하는 곳... 그린진바이오텍, 031-330-6193, 추천인;박윤식^^ 수고하시고 결과 ...
답변 1  |  2004.11.02
Q. 시퀀싱 결과 분석과 관련하여 질문드립니다.
20bp나 30bp를 잘라낸 후에 진행하는 것으로 알고 있는데, 시퀀싱 결과가 꽤 poor해서 더 많이 잘라내어야 할 것 같습니다. 그래서 20~30bp가 아닌 300bp 정도를 잘라내고 진행해도 되는지 궁금합니다 ...
A.  1. Reverse로 읽은걸 reverse complementation 후에 forward와 contig 만들어 BLAST 돌리는 것이 정석입니다. Reverse complementation 하지 않고 그냥 돌려도, forward로 읽은 것만을 query로 한 BLAST 결과가 나오겠지만요. 여기 ...
답변 2  |  2017.01.26
Q. 시퀀싱 결과 오류
회사의 프라이머로 ATG와 stop codon도 못 읽어 내고 있는 시퀀싱 결과를 보고 제가 잘못했다고 생각해야 되는지 아니면 회사 측에 문제가 있는 것인지. 제가 어떻게 하면 좋을까요? 조언 부탁드립니다 ...
A.  저는 plasmid에서 시퀀싱해야 되는 영역을 포함해서 PCR하고 그 PCR product를 시퀀싱 맡겼습니다.
답변 4  |  2014.08.23
Q. 시퀀싱이요~
두 가지로 다 할 필요는 없지 않나요? 어차피 하나로만 시퀀싱해도 결국에는 같은 시퀀스가 되는거 아닌가요 ...
A.  유전자를 시퀀싱할 경우 양쪽으로 읽게 되는데 이건 보통 시퀀싱 결과가 100% 일치하지 않기 때문이죠. 쉽게 말해 1kb 를 읽었다면 가운데 700~800 bp 는 제대로 읽어도 양 끝에는 반응이 잘 안되거나 하는 ...
답변 1  |  2007.04.09
Q. 시퀀싱 프라이머에 대해...
뭐 그런..(그게 미생물에 전부있어서 그걸 쓴다고 하던데..) 시퀀싱프라이머랑 pcr 프라이머는 엄연히 다른거구..? 그리고..곰팡이같은 경우에는 어떤 프라이머를 써야되는지 잘 모르겠네요 질문이 ...
A.  Forward, reverse는 완전히 인위적인 개념입니다. 왜 이게 포워드고 저건 리버스냐 하면, 그건 벡터 만든 사람 맘이죠~ 라고 밖에는 할말이 없습니다. promoter에서 insert가 들어가는 MCS 사이에 있는 것을 ''포 ...
답변 5  |  2007.06.10
Q. CLUSTALW 를 통한 시퀀싱결과에 대한 질문요..
안녕하세요. 제가 이번에 학교 과제 일환으로 두가지 비슷한 단백질을 CLUSTALW 를통해 시퀀싱한 결과를 ... 8932 점과 2461점이 의미하는바도 정확히 모르겠습니다. 시퀀싱 고수님들..부디 도와주세요 ...
답변 0  |  2009.04.01
Q. gDNA 시퀀싱
위치한 시퀀스로 시퀀싱용 프라이머를 새로이 만들어서 시퀀싱해야 하는건가요? 혹은 다른 방법이 있는지요? 감사합니다. -_ ...
A.  inverse PCR이면 될 것 같습니다. 적당한 제한효소로 자르고 DNA ligase로 self circle을 만든 후 바깥쪽 방향으로 배치된 프라이머로 PCR을 하는 겁니다. genome walking 키트제품들도 고려해 볼 수 있고요.
답변 2  |  2019.11.20
Q. 시퀀싱 결과 해석
로 읽을 수 있을까요? blast 돌렸더니 원래 염기서열은 caa 인데 시퀀싱 결과 c-a여서.... 이곳이 deletion mutation이라고 봐도 될지요...
A.  저도 강시님 의견과 동일하게 GGTTCAA 라고 생각합니다 다만 30 bp 내외인데도 peak 이 낮고 퀄리티가 좋지 않네요. 재반응 또는 반대방향 primer로 추가 시퀀싱이 반드시 필요해 보입니다.
답변 7  |  2015.11.11
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