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실험Q&A    121건 정확도순 날짜순
Q. GC(MIDI) 균동정 calibration mixure solvent peak 인식
ㅠㅠ 다름이 아니라 균동정 MIDI를 사용하고 있어요 기기에 점화 이상이 있어서 column 3 cm 정도 끊었습니다. 그리고 standard로 calibration mix를 찍었는데 기존 정상작동한 첫번째 peak가 solvent peak인데 지금은 ...
답변 0  |  2013.03.15
Q. 16s rRNA로 동정 방법.
동정하고 있습니다. 16s rRNA로 ... ㅠㅠ 16s rRNA로 균동정하는 실험방법 좀 자세히 알려주실 고수님들 부탁드립니다.ㅜㅜ 종은 혐기적 조건에서 Lactobacilli MRS agar (DIFCO)에서 분리하여 젖산 속으로 ...
A.  첨부 문서 참고 하세요
답변 1  |  2009.09.28
Q. 동정 관련질문드립니다.
나옵니다. 이럴경우 신규주로 생각을해도되는건가요? 16s ... 될지 조언부탁드립니다.. 혹시 균동정해보신분들 조언좀 해주세요.. ...
A.  16S rRNA gene sequence similarity 가 97% 이상이면 신종 (신규 주)라고 말하지 않습니다. 혹, 97% 이상을 보이지만, 다른 특성이 기존의 주와 다르다고 판단되면 97% 이상을 보인 주와의 DNA-DNA hybridization 을 ...
답변 3  |  2014.12.13
Q. 16S sequencing 결과에 분석에 여쭈여봅니다.  |  첨부파일 첨부파일
거꾸로 하였구요.) blast로 이 주가 무엇인지 알아보고자 ... 해야 할 지 모르겠네요.. 1. 균동정하는 방법이 전체적으로 어떤 프로그램을 사용해서 어떤 과정을 거쳐야 하는지 알려주세요..(시퀀싱 ...
A.  1. 저는 NCBI 홈페이지에서 Blast를 이용하고 있습니다. 2. N 은 noise가 일어난 것으로 저는 제거 하고 붙입니다. 하지만 처음에 나온 N만을 제거 하며 나머지 중간에 나올 경우 제거하지 않고 그냥 붙여 넣 ...
답변 1  |  2013.06.12
Q. 균동정 API kit 실혐법
API kit 실험법좀 알려주세요
답변 0  |  2009.09.02
Q. 미생물 동정에 궁금한데 있습니다.
일반세 실험을 하였더니 세수가 꽤 나오더라구요. 샘플은 ... 그래서 여기서 나온 을 어떤 속인지 까지만이라도 동정을 해보고 싶은데, 어떤식으로 하면 될까요?? DNA추출하여 PCR로 확인하는 ...
A.  http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 궁금한 미생물을 동정해 보는 것도 좋지만, 우선 실험이 무적으로 제대로 수행되었는지 검토해 보시기 바랍니다. 그리고, 살아서 나온 미생물이 다시 멸했을 때도 ...
답변 1  |  2010.10.29
Q. NCBI 유전자 등록
안녕하세요. 제가 미생물체를 ITS영역 시컨싱 후 균동정을 완료하여 유전자 등록을 하려고 하는데 절차를 모르겠어서 이렇게 질문합니다. 자세한 답변 부탁드립니다.
A.  Genbank 시퀀스 등록을 자세히 대답하려면 결국 매뉴얼이 되어 버립니다. 시퀀스가 몇개 안된다면 Bankit 메뉴를 이용한 direct submission이 편리하실거고, 여러개라면 NCBI에서 시퀀스 등록용으로 개발한 소 ...
답변 1  |  2011.07.12
Q. 주 색깔이.....바뀌었어요ㅠㅠ
pseudotuberculosis 라는 주가 동정되었습니다. 그래서 TSA ... 혹시 오염된건 아닌지 균동정을 다시 하였더니 같은 으로 판명되었습니다. 이 색깔이 이렇게 바뀔 수가 있나요? ...
A.  박테리아의 탄소원과 질소원의 농도가 바뀌면 pigment를 내는 일/이차의 대사 정도가 바뀔 수 있습니다. 일반적으로 Corynebacterium pseudotuberculosis 의 blood agar에서는 흰색 또는 무색 colony를 형성 하는것으로 ...
답변 1  |  2011.11.09
Q. Primer 서열중 R과 Y
Lactobacillus 을 16s rRNA 목적물질로 하여 균동정을 하려고 합니다. 논문을 참고하여 primer 제작을 하려고 하는데 논문상에서 찾을수 있는 Lactobacillus delbreckii 의 primer는 F : GGRTGATTTGTTGGACGC / R : ...
A.  그 위치의 DNA 염기가 하나가 아니라 둘 이상일 때 그런 기호를 사용합니다. 염기 서열 중의 R 은 Purine (A or G) Y 는 Pyrimidine (C or T) 이고, 말씀하신 R 은 Reverse 서열을 의미하는 R 입니다. 그러니까 R 은 A가 ...
답변 1  |  2016.06.07
Q. 16srrna 와 데이터해석  |  첨부파일 첨부파일
첨부드린 논문에서 보시면, 성장 곡선을 Realtime pcr을 통해 ... 이해가 되질 않습니다...ㅠㅠ 균동정을 위한 16s rrna 동정법을 자세히 아시는 분있으시면 꼭 답변부탁드리겠습니다 ...
답변 0  |  2016.12.05
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MicroSEQ Rapid ID System | (재)경북바이오산업연구원 | 2013.05.30
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VITEK 2 COMPACT 60 | 안전성평가연구소 | 2011.03.14
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