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Q. 계통수 그림에 대해서 질문드립니다. | 첨부파일 |
숫자가 어떤 의미하는지 잘 모르겠습니다.
첨부한 파일은 계통수 그림이며 A는 strict consenssus tree of three equally parsimonious trees 이고, B는 Neighbor-joining tree 입니다.
각각의 그림에서 나타내는 숫자의 의미는 ... |
답변 0 | 2019.04.02 |
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Q. 계통수(phylogenetic tree) 질문입니다. | 첨부파일 |
만들려고 합니다.
보통은 0,1 과 같은 차이로 만드는 계통수 프로그램이 있는데...
0,1,2,3,4,5 이렇게 다양한 차이가 있을때 어떤 프로그램을 쓰는지 궁금합니다.
그리고 첨부한 논문에서 strict consensus ... |
답변 0 | 2019.03.22 |
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Q. 이 계통수 데이터를 어떻게 해석해야 할까요? |
보고 당황했습니다.
그래서 여기 표시된 균주들의 16s rRNA로 계통수를 그려보니 결과는 보시다시피 근연관계가 상당히 먼것으로 표시됩니다.
이 두 데이터가 이렇게 다른 결과를 보여주는 이유가 ... |
A. 16s rRNA서열들을 비교한겁니다. |
답변 3 | 2019.05.21 |
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Q. 계통수 그릴 때 비교균주(?) 선택하는 방법이 궁금합니다. |
미생물은 모두 유사하기 때문에 다른 미생물을 선별한 후 계통수를 그린다면 어떤 기준으로 다른 미생물을 선택하는지 궁금합니다.
3. 아래 그림에 나와있는 미생물 중에서도 특정 미생물을 ... |
A. 빨리 아무나 답장 해주세요 ㅠㅠ 현기증난단말이에요 |
답변 1 | 2018.01.30 |
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Q. 계통수 보는법 |
을 이용해서 계통수를 그렸는데 neighbor-joining법으로 했습니다.
그런데 조류1, 조류2, 어류1, 어류2, 파충류1, 파충류2 중에서 어류1,2 먼저 가지가 나뉘고
그 다음에 파충류1과 나머지로 가지가 나뉩니다. ... |
A. 계통학적으로 조류를 포함한 넓은 의미의 파충류, 그러니까 용궁류는 단계통군이지만
조류를 제외한 좁은 의미의 파충류는 측계통군이기 때문에 파충류 1이 먼저 따로 분기할 수도 있습니다.
어류는 ... |
답변 2 | 2016.10.11 |
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Q. 계통수 작성 관련해서 여쭤봅니다. |
제가 MEGA 6를 이용하여 계통수를 작성하는데
upload_image
A, B, C, D 모두 동일한 서열로 실행했습니다. 동일한 서열이기 때문에 저 형태의 결과가 나오면 안되지않나요?
그리고 수치표시가 안되던데 ... |
A. 계통을 묶어가는 과정에 따라서 여러 모양이 나올 수 있습니다. 그래서 거리행렬을 구하는 방법이나 그룹핑 방법이 여러가지가 있는 것이구요. 특히 묶어가는 순서에 따라서 모양이 달라질 수 있습니 ... |
답변 2 | 2019.04.04 |
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Q. 계통수 scale bar... | 첨부파일 |
계통수(phylogenetic tree)를 그리는 중인데요.
프로그램은 Mega 7 사용중입니다.
Mega 프로그램이 익숙치 않아 질문드리려구요.
첨부된 파일의 그림 1~4와같이 진행을 했는데, 마지막 phylogenetic tree의
scale bar ... |
답변 0 | 2019.05.30 |
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Q. 계통수에서 bootstrap value? |
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제가 계통수를 이용한 phylogenetic analysis를 공부하고 있는데요..
bootstrap value라는것이 있던데..그 값이 의미하는게 뭔가요?
높은 숫자일수록 좋은건가요?
그리고 NCBI blast했을때 가장 위에 올라와 있는게 ... |
답변 0 | 2009.10.27 |
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Q. powermarker- 계통수 | 첨부파일 |
프로그램으로 계통수 그리려고하는데
MEGA encountered a problem importing your newick file, it may not be ea valid newick standard fileAccess violation at address 0000000001145978 in module 'MEGA7.exe'. Read of address 00000000000000.
이메세지가 ... |
답변 0 | 2018.03.07 |
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