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| Q. 이 계통수 데이터를 어떻게 해석해야 할까요? |
| 보고 당황했습니다.
그래서 여기 표시된 균주들의 16s rRNA로 계통수를 그려보니 결과는 보시다시피 근연관계가 상당히 먼것으로 표시됩니다.
이 두 데이터가 이렇게 다른 결과를 보여주는 이유가 ... |
| A. 16s rRNA서열들을 비교한겁니다. |
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답변 3 | 2019.05.21 |
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| Q. SNP 이용하여 계통수 그리기 |
| .?
정리: 10개 SNP marker에 대한 정보로 100개체에 대한 계통수를 그릴수 있나요?
혹시 가능하다면 어떤 프로그램을 쓰는게 좋을까요??
***짐작이라도 좋고 가르치는 말이라도 좋으니 알려주시면 ... |
| A. sequence alignment가 필요없으니 fasta 파일로 만들어 MEGA에서 계통수 분석 가능하지 않을까 싶네요. 근데 얼마나 신빙성이 있을진 모르겠네요. 관련 분야 논문 그림을 보여주시면 좀 더 말씀드릴 수 있지 ... |
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답변 1 | 2014.09.29 |
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Q. 계통수(phylogenic tree) 질문입니다. |  첨부파일 |
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2. 계통수에서 맨아래 표시된 bar (――――― 0.1)의 의미
계통수 밑의 시퀀스 상동성 히트맵에 대한 조언도 있으시면 부탁드립니다.
감사합니다 ... |
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답변 0 | 2020.10.05 |
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| Q. mad scientist 님 좀 도와주세요!PHYLIP을 이용한 계통수 그리는 방법.. |
| .(inconsistent nuber of species in data set 2)
도와주세요...ㅠ_ㅠ
계통수 그림이 있어야지..결과도 쓸 수가 있는데...부탁드려요. ... |
| A. 이메일도 보내셨네요. 지금에서야 읽었습니다. 버섯 계통 분류하는 실험실이 그다지 많지 않던데.. 서울대 정학성 교수님께서 아직까지 지존이신것으로 알고 있고.. 그리고 농진청에 김양섭 박사님도 ... |
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답변 3 | 2006.06.01 |
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| Q. 계통수 그림에 대해서 질문드립니다. | 첨부파일 |
| 숫자가 어떤 의미하는지 잘 모르겠습니다.
첨부한 파일은 계통수 그림이며 A는 strict consenssus tree of three equally parsimonious trees 이고, B는 Neighbor-joining tree 입니다.
각각의 그림에서 나타내는 숫자의 의미는 ... |
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답변 0 | 2019.04.02 |
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| Q. 계통수(phylogenetic tree) 질문입니다. | 첨부파일 |
| 만들려고 합니다.
보통은 0,1 과 같은 차이로 만드는 계통수 프로그램이 있는데...
0,1,2,3,4,5 이렇게 다양한 차이가 있을때 어떤 프로그램을 쓰는지 궁금합니다.
그리고 첨부한 논문에서 strict consensus ... |
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답변 0 | 2019.03.22 |
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| Q. 계통수 그릴 때 비교균주(?) 선택하는 방법이 궁금합니다. |
| 미생물은 모두 유사하기 때문에 다른 미생물을 선별한 후 계통수를 그린다면 어떤 기준으로 다른 미생물을 선택하는지 궁금합니다.
3. 아래 그림에 나와있는 미생물 중에서도 특정 미생물을 ... |
| A. 빨리 아무나 답장 해주세요 ㅠㅠ 현기증난단말이에요 |
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답변 1 | 2018.01.30 |
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| Q. 계통수 보는법을 알고싶어요 |
| Similarity가 다른가지에 있는 종이 가장유사하다고 나왔는데 계통수상에서는 거리가 있는 이유가 무었인가요 ... |
| A. 1. 현재 이 계통도 상으로는 맞지만, 어떤 Sequence로 하였는지에 따라 달라 질 수 있습니다.
2. Bootstrap value 라고 해서 간단하게 말하면 반복시의 신뢰도를 의미 합니다.
가령 100이면 100번 계통도를 그려 ... |
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답변 3 | 2015.10.24 |
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| Q. 계통수 보는법 |
| 을 이용해서 계통수를 그렸는데 neighbor-joining법으로 했습니다.
그런데 조류1, 조류2, 어류1, 어류2, 파충류1, 파충류2 중에서 어류1,2 먼저 가지가 나뉘고
그 다음에 파충류1과 나머지로 가지가 나뉩니다. ... |
| A. 계통학적으로 조류를 포함한 넓은 의미의 파충류, 그러니까 용궁류는 단계통군이지만
조류를 제외한 좁은 의미의 파충류는 측계통군이기 때문에 파충류 1이 먼저 따로 분기할 수도 있습니다.
어류는 ... |
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답변 2 | 2016.10.11 |
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