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논문 소개 - 2
Scientist (2009-08-17 17:18:38)
 추천 : 0, 비추천 : 0, 조회: 4255 | 인쇄하기 | 소셜네트워크로 공유하기

오랜만에 들어왔네요.. 쩝.. ^^;;

죄송해요.

그동안 좀 개인적으로 많은 일들이 있어서...

개인적인 것은 개인적인 것이니깐...

계속 metagenome 논문에 대한 소개를 진행하자면...

첫 번째에는 Ventor의 논문을 소개하였습니다.

이어서 본 글에서는  미생물 생태학 분야에 있어서 가장 hot issue를 만들어낸 논문을 소개하고자 합니다.

전 세계적으로 고세균 특히 비극한 고세균에 대한 연구는 매우 많이 진행되고 있으며, 미생물 생태학 분야에서 가장 issue가 되는 분야 중 하나입니다.

물론 다른 것들도 중요하지 많요.

그러나 2005년 Envirionmental Microbiology 라는 저널에서 "Novel genes for nitrite reductase and Amo-related proteins indicate a role of uncultivated mesophilic crenarchaeota in nitrogen cycling"라는 제목의 논문이 실리게 됩니다.

아마 한국에서는 거의 관심을 받지 못했던 논문일 것입니다.

이 논문은 당시 노르웨이 대학교에 있는 여성과학자Schleper C. 그룹에서 나온 것이고,

soil 환경에서 직접 DNA를 뽑아 metagenome library를 만들어 비극한 고세균의 16S rRNA gene을 찾는 도중에

bacteria에만 존재하는 것으로 알고 있었던 Amo-related protein을 coding하는 유전자를 찾게 됩니다.

Amo 유전자는.. 호기적 질소 순환의 첫 단추인 ammonia oxidation의 key enzyme인 ammonia monooxygenase 입니다. 그동안 세균만 지닌 것으로 알려져 있었죠.

다시 말하자면, 아무런 쓸모가 없는 것으로 알려져 있던 비극한 고세균이 지구상의 질소 순환에 영향을 미칠 것이다라는 것을 유전체학을 통하여 분석해 낸 것이죠.

이후 미국, 영국, 독일, 네덜란드 등 미생물 생태학 분야의 선진 과학자들이 이에 대한 분자생물학적인 방법을 이용하여 이를 상당량 증명하게 됩니다.

다양한 환경에서 암모니아를 산화하는 고세균이 세균보다 많다는 것을요. 하지만 이 역시도 case by case가 되었지만요.

방금 구글에서 찾아보니.. 125회나 citation이 되었더라고요. 물론 제 논문에도 본 논문이 citation 되었습니다만...

여하튼 본 논문을 기점으로 하여 암모니아 산화 고세균에 대한 연구는 nature, science, PNAS, EM, AEM, FEMS Microbiology Ecology 등..

미생물 생태학 분야의 Top journal에 실리게 됩니다. 어마어마한 파워를 지니게 된 것이죠...

우리나라도 미생물 생태학 분야에서 community genomics, comparative genomics, metagenomics, non-thermophilic archaea에 대한 연구가 많이 진행되면 좋겠습니다.

실제로 ISME(전세계 최대의 미생물 생태학회죠...)에서 대부분 저 위의 연구가 많이 발표가 되거든요....

Citing URL : https://www.ibric.org/scicafe/read.php?Board=scicafe000252&id=81
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