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 전체 > Chemical biology > Synthesis
질문 유기화합물 합성 때, "아! 이건 합성하기 쉽겠다"는 화합물들의 특징이 있나요?
올챙이김돌돌(과기인)  |  2019.05.21

안녕하세요. 한 연구실에서 근무하고 있는 박사연구원입니다.

저는 현재 단백질 구조를 통해 그 단백질의 새로운 억제제를 디자인하고 있습니다.

유기합성이 아닌 전혀 다른 전공으로 졸업했기에 부족하지만 혼자서 공부하면서 이것저것 시도해보고 있습니다.

유기합성은 학부 저학년 때, 전공과목으로 배운 적이 있는데, 그 과목 외엔 쓸 일이 없어서 지금에 와서는 거의 까먹었습니다.. 배운지가 10년이 넘었네요..

 

최근에는 괜찮아보이는 단백질억제제를 디자인했습니다.

그래서 이 화합물을 유기합성회사에 의뢰해서 견적을 받아봤습니다.

분자량은 1 kDa정도지만 제 나름 생각하기에 쉬운 구조를 가지고 있어서 (구조의 각 부분부분을 저렴하게 구매 가능) 그렇게 큰 금액이 되지 않을 것이라 생각했습니다. 게다가 구조가 쉬우니까 시간도 그렇게 오래 걸리지 않겠지라고 생각했는데...

 

5 mg, 95% 순도로 합성하는데 견적을 받으니 한 화합물 당 천만원이더라구요...

합성도 2개월 넘게 소요되고 합성 성공율도 생각보다 낮았고..

게다가 실제로 합성해서 실험한다고 해도 좋은 실험결과가 나올지도 미지수고..

 

그래서 침울해졌습니다 ㅠㅠ

하지만 다행히도 연구책임자께서는 위 상황을 충분히 아시며, 저보고 유기합성 의뢰해서 실험해보라고 격려해주셨습니다. 그래서 유기합성은 진행할 예정입니다.

 

이번엔 유기합성을 의뢰해서 실험을 진행하겠다만...

다음 번에 디자인할 때는 뭔가 나아진 모습이 되고 싶습니다. 그치만 유기합성 때, 뭔가 조언을 받고 싶어도 주변에 있는 사람들도 역시 유기합성 전공하신 분이 없어 디자인 때 많은 어려움이 있네요.

그래서 브릭에 계시는 유기합성 관련분들에게 질문을 드립니다.

 

1. 유기합성 할 때, "아! 이건 합성하기 쉽겠다"는 화합물들의 특징이 있나요?

합성하기 쉬운 구조로 디자인하게 되면, 돈도 적게 들고 시간도 짧게 소요되니까 

물론, 유기합성에는 다양한 바리에이션이 있다고 생각합니다.

경험이 없는 제가 생각해봐도 간단한 화합물의 특징을 한 가지로 설명할 수 있는 일도 아니고 경험에 따라서 의견이 분분할 수도 있고.. 하지만 여러분들의 경험담을 들어보고 싶습니다. "~~한 구조를 가진 물질이 합성하기 쉬웠고, ~~ 작용기에 ~~를 붙이는게 성공률이 좋았다"라는 식으로 혹시 의견을 여쭈어도 될까요?

 

2. 유기합성 회사에서 주는 견적에서 금액에 크게 영향을 미치는 것은 무엇인가요? 

용량, 순도, 구조가 아무래도 클 것 같습니다. 하지만 유기합성 전공이 아니다보니 어느 부분이 가격에 크게 영향을 주는지 와닿지가 않네요.. 

순도를 약간 높이기만 해도 금액이 그렇게 크게 차이가 나나요? 

그리고 합성 후에 크로마토그래피로 합성한 화합물을 확인할 때, 그 때 사용하는 크로마토그래피 컬럼 등도 견적에 전부 들어가는 거겠죠?

 

전공과 전혀 다른 분야라서 잘 감이 오지 않네요.

유기합성 전공자분들이 보시기에 바보같은 질문일수도 있습니다.

하지만 양해부탁드리고 답변 부탁드리겠습니다.

감사합니다!

#유기합성
#억제제
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