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 전체 > Omics > Genomics
질문 Sequence정보로부터 gene ID mapping...
알sshhjj(대학원생)  |  2017.07.29
 안녕하세요
Gene에 대한 정보가 잘알려지지 않은 플라나리아와 같은 종을 RNA sequencing했습니다.
GeneID가 entrez나 ensembl과 같은 major한 ID로 mapping이 안되는데,
fasta파일이나 gtf 또는 RNA seq expression data로 특정 다른 한 종으로
gene ortholog mapping을 할 수 있는 tool이나 web service에 대해 알려주시면 감사하겠습니다.
Blast 등을 시도해봤는데, 여러 종으로 mapping되거나, 전체 fasta파일을 input으로 집어넣기 쉽지 않더라구요..

부탁 드립니다.



#ortholog
#blast
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