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신우리
신우리 (Woo-Ri Shin) 저자 이메일 보기
충북대학교
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  CV updated 2022-05-09 14:41
 
조회 140  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Structure based innovative approach to analyze aptaprobe–GPC3 complexes in hepatocellular carcinoma
열기 Authors and Affiliations

Abstract

Background
Glypican-3 (GPC3), a membrane-bound heparan sulfate proteoglycan, is a biomarker of hepatocellular carcinoma (HCC) progression. Aptamers specifically binding to target biomolecules have recently emerged as clinical disease diagnosis targets. Here, we describe 3D structure-based aptaprobe platforms for detecting GPC3, such as aptablotting, aptaprobe-based sandwich assay (ALISA), and aptaprobe-based imaging analysis.

Results
For preparing the aptaprobe–GPC3 platforms, we obtained 12 high affinity aptamer candidates (GPC3_1 to GPC3_12) that specifically bind to target GPC3 molecules. Structure-based molecular interactions identified distinct aptatopic residues responsible for binding to the paratopic nucleotide sequences (nt-paratope) of GPC3 aptaprobes. Sandwichable and overlapped aptaprobes were selected through structural analysis. The aptaprobe specificity for using in HCC diagnostics were verified through Aptablotting and ALISA. Moreover, aptaprobe-based imaging showed that the binding property of GPC3_3 and their GPC3 specificity were maintained in HCC xenograft models, which may indicate a new HCC imaging diagnosis.

Conclusion
Aptaprobe has the potential to be used as an affinity reagent to detect the target in vivo and in vitro diagnosing system.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2022년 04월 (BRIC 등록일 2022-05-09)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Biotechnology, Molecular_Biology, Systems Biology
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