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이량근
이량근 (Ryanggeun Lee) 저자 이메일 보기
KAIST
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  CV updated 2022-01-11 20:05
 
조회 206  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
CTCF-mediated chromatin looping provides a topological framework for the formation of phase-separated transcriptional condensates
열기 Authors and Affiliations

Abstract

CTCF is crucial to the organization of mammalian genomes into loop structures. According to recent studies, the transcription apparatus is compartmentalized and concentrated at super-enhancers to form phase-separated condensates and drive the expression of cell-identity genes. However, it remains unclear whether and how transcriptional condensates are coupled to higher-order chromatin organization. Here, we show that CTCF is essential for RNA polymerase II (Pol II)-mediated chromatin interactions, which occur as hyperconnected spatial clusters at super-enhancers. We also demonstrate that CTCF clustering, unlike Pol II clustering, is independent of liquid-liquid phase-separation and resistant to perturbation of transcription. Interestingly, clusters of Pol II, BRD4, and MED1 were found to dissolve upon CTCF depletion, but were reinstated upon restoration of CTCF, suggesting a potent instructive function for CTCF in the formation of transcriptional condensates. Overall, we provide evidence suggesting that CTCF-mediated chromatin looping acts as an architectural prerequisite for the assembly of phase-separated transcriptional condensates.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2021년 12월 (BRIC 등록일 2022-01-11)
- 연구진: 국내연구진태극기
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