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김아롬
김아롬 (Ahrom Kim) 저자 이메일 보기
Auburn University
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Immunoglobulin Class Switch Recombination Is Initiated by Rare Cytosine Deamination Events at Switch Regions
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Abstract

Activation-induced cytidine deaminase (AID) initiates immunoglobulin (Ig) class switch recombination (CSR), somatic hypermutation (SHM), and gene conversion by converting DNA cytosines to uracils at specific genomic regions. In this study, we examined AID footprints across the entire length of an engineered switch region in cells ablated for uracil repair. We found that AID deamination occurs predominantly at WRC hot spots (where W is A or T and R is A or G) and that the deamination frequency remains constant across the entire switch region. Importantly, we analyzed monoallelic AID deamination footprints on both DNA strands occurring within a single cell cycle. We found that AID generates few and mostly isolated uracils in the switch region, although processive AID deaminations are evident in some molecules. The frequency of molecules containing deamination on both DNA strands at the acceptor switch region correlates with the class switch efficiency, raising the possibility that the minimal requirement for DNA double-strand break (DSB) formation is as low as even one AID deamination event on both DNA strands.

논문정보 F1000선정
- 형식: Research article
- 게재일: 2020년 07월 (BRIC 등록일 2020-09-07)
- 연구진: 국외연구진
- 추천: Faculty of 1000 Biology
- 추천사유: Lieber M:Faculty OpinionsRecommendation of [Kim A et al., Mol Cell Biol 2020 40(16)].In Faculty Opinions, 01 Sep 2020; 10.3410/f.738116366.793577717
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김현민
발표: 김현민 (KAIST)
일자: 2020년 9월 29일 (화) 오후 02시 (한국시간)
언어: 한국어
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