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곽철환
곽철환 (Chulhwan Kwak) 저자 이메일 보기
서울대학교, UNIST
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Contact-ID, a tool for profiling organelle contact sites, reveals regulatory proteins of mitochondrial-associated membrane formation
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Abstract

The mitochondria-associated membrane (MAM) has emerged as a cellular signaling hub regulating various cellular processes. However, its molecular components remain unclear owing to lack of reliable methods to purify the intact MAM proteome in a physiological context. Here, we introduce Contact-ID, a split-pair system of BioID with strong activity, for identification of the MAM proteome in live cells. Contact-ID specifically labeled proteins proximal to the contact sites of the endoplasmic reticulum (ER) and mitochondria, and thereby identified 115 MAM-specific proteins. The identified MAM proteins were largely annotated with the outer mitochondrial membrane (OMM) and ER membrane proteins with MAM-related functions: e.g., FKBP8, an OMM protein, facilitated MAM formation and local calcium transport at the MAM. Furthermore, the definitive identification of biotinylation sites revealed membrane topologies of 85 integral membrane proteins. Contact-ID revealed regulatory proteins for MAM formation and could be reliably utilized to profile the proteome at any organelle–membrane contact sites in live cells.

mitochondria-associated membrane (MAM), membrane contact site, proximity labeling, membrane protein topology, FKBP8

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2020년 05월 (BRIC 등록일 2020-05-18)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Cell_Biology
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