[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 한국을 빛내는 사람들
https://www.ibric.org/myboard/list.php?Board=news&PARA3=54
스폰서배너광고 안내  배너1
전체보기 추천논문 상위피인용논문 인터뷰 그이후 한빛사통계
정재윤
정재윤 (Jaeyoon Chung) 저자 이메일 보기
Massachusetts General Hospital
  인터뷰보기 
조회 479  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Genome-wide association study of cerebral small vessel disease reveals established and novel loci
열기 Authors and Affiliations

Abstract

Intracerebral haemorrhage and small vessel ischaemic stroke (SVS) are the most acute manifestations of cerebral small vessel disease, with no established preventive approaches beyond hypertension management. Combined genome-wide association study (GWAS) of these two correlated diseases may improve statistical power to detect novel genetic factors for cerebral small vessel disease, elucidating underlying disease mechanisms that may form the basis for future treatments. Because intracerebral haemorrhage location is an adequate surrogate for distinct histopathological variants of cerebral small vessel disease (lobar for cerebral amyloid angiopathy and non-lobar for arteriolosclerosis), we performed GWAS of intracerebral haemorrhage by location in 1813 subjects (755 lobar and 1005 non-lobar) and 1711 stroke-free control subjects. Intracerebral haemorrhage GWAS results by location were meta-analysed with GWAS results for SVS from MEGASTROKE, using ‘Multi-Trait Analysis of GWAS’ (MTAG) to integrate summary data across traits and generate combined effect estimates. After combining intracerebral haemorrhage and SVS datasets, our sample size included 241 024 participants (6255 intracerebral haemorrhage or SVS cases and 233 058 control subjects). Genome-wide significant associations were observed for non-lobar intracerebral haemorrhage enhanced by SVS with rs2758605 [MTAG P-value (P) = 2.6 × 10−8] at 1q22; rs72932727 (P = 1.7 × 10−8) at 2q33; and rs9515201 (P = 5.3 × 10−10) at 13q34. In the GTEx gene expression library, rs2758605 (1q22), rs72932727 (2q33) and rs9515201 (13q34) are significant cis-eQTLs for PMF1 (P = 1 × 10−4 in tibial nerve), NBEAL1, FAM117B and CARF (P < 2.1 × 10−7 in arteries) and COL4A2 and COL4A1 (P < 0.01 in brain putamen), respectively. Leveraging S-PrediXcan for gene-based association testing with the predicted expression models in tissues related with nerve, artery, and non-lobar brain, we found that experiment-wide significant (P < 8.5 × 10−7) associations at three genes at 2q33 including NBEAL1, FAM117B and WDR12 and genome-wide significant associations at two genes including ICA1L at 2q33 and ZCCHC14 at 16q24. Brain cell-type specific expression profiling libraries reveal that SEMA4A, SLC25A44 and PMF1 at 1q22 and COL4A1 and COL4A2 at 13q34 were mainly expressed in endothelial cells, while the genes at 2q33 (FAM117B, CARF and NBEAL1) were expressed in various cell types including astrocytes, oligodendrocytes and neurons. Our cross-phenotype genetic study of intracerebral haemorrhage and SVS demonstrates novel genome-wide associations for non-lobar intracerebral haemorrhage at 2q33 and 13q34. Our replication of the 1q22 locus previous seen in traditional GWAS of intracerebral haemorrhage, as well as the rediscovery of 13q34, which had previously been reported in candidate gene studies with other cerebral small vessel disease-related traits strengthens the credibility of applying this novel genome-wide approach across intracerebral haemorrhage and SVS.

Keywords: genome-wide association studies, cerebral small vessel disease, multi-trait analysis

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2019년 08월 (BRIC 등록일 2019-09-02)
- 연구진: 국외연구진
- 분야: Neuroscience
관련 인터뷰
1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 뇌졸중 (stroke)은 미국 내에서 사망원인 5위입니다 (Benjamin et al. 2018). 뇌졸중은 크게 뇌출혈 (intracerebral hemorrhage; ICH)과 뇌경색 (ischemic stroke; IS)으로 나뉩니다. 뇌출혈은 뇌경색에 비해 상대적으로 적은 (미국에서는 뇌졸중의 13%) 비중을 차지하지만 5년내 사망률 60-80%로 상당히 높고 발병 후에는...
Leucyl-tRNA synthetase 1에 의한 포도당 의존적 류신 감지 및 대사 조절[Science]
윤이나
발표: 윤이나 (서울대학교)
일자: 2020년 2월 28일 (금) 오후 02시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
NK세포에 의한 손상된 말초신경 제거 기전 – 새로운 만성통증 치료법[ Cell ]
오석배
발표: 오석배 (서울대학교)
일자: 2020년 3월 5일 (목) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
ATAD5가 복제 스트레스 상황에서 복제를 재개하는 세포생물학적 기작[ Nat. Commun.]
박수형
발표: 박수형 (기초과학연구원)
일자: 2020년 3월 12일 (목) 오후 03시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기

  댓글 0
등록
 
목록
오스테오시스
관련링크
정재윤 님 전체논문보기 >
관련인물
전경아 (Boston Universi...)
관련분야 논문보기
Neuroscience

외부링크
Google (by Jaeyoon Chung)
Pubmed (by Jaeyoon Chung)
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
[BRIC Webinar]NK세포에 의한 손상된 말초신경 제거 기전 – 새로운 만성통증 치료법[Cell]
[BRIC Webinar]Leucyl-tRNA synthetase 1에 의한 포도당 의존적 류신 감지 및 대사 조절[Science]
[대전] Synthego CRISPR Genome Editing User Seminar에 초대합니다.
[대전] Synthego CRISPR Genome Editing User Seminar에 초대합니다.
날짜: 2020.03.05
장소: 한국생명공학연구원 본관동 대회의실(B)
[고용부 재직자 무료과정]의료기기 GMP의 이해 과정
[고용부 재직자 무료과정]의료기기 GMP의 이해 과정
날짜: 2020.03.09~11
장소: 성남시 분당구 판교로289번길 20 스타트업캠퍼스 2층 세미나실
2020 서경배과학재단 신진과학자 연구지원 프로그램
2020 서경배과학재단 신진과학자 연구지원 프로그램
날짜: 2020.03.31
주관: 서경배과학재단
위로가기
한빛사 홈  |  한빛사FAQ  |  한빛사 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
에펜도르프코리아