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SNPAnalyzerPro_brochure
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제품 생산일
2006.06.01
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원산지
대한민국
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생산기업
(주)이즈텍
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첨부파일
-- 주요 특징 --
1. Affymetrix, Illumina 사에서 생산되는 whole-genome SNP 데이터를 입력으로 받아들여 빠른 시간내에 batch 실행이 가능합니다. 최대 500,000 개 이상의 SNP, 2,000 개 이상의 샘플 데이터 분석이 가능합니다.
2. 사용자가 가장 사용하기 쉬운 형태로 연관 불평형 분석 (LD Analysis) 및 연관성 분석 (Association Analysis) 인터페이스를 구성하였습니다.
3. 분석 결과는 서로 연결되어 있어 수많은 SNP 들 중에서 통계적, 유전학적으로 보다 의미있는 결과를 제시해줍니다.
4. 분석된 결과는 내장되어있는 SNP 주석 데이터와 연동시켜 실시간으로 함께 제공하여 줍니다.
5. 현재 미국 식약청에 납품되어 있습니다.
-- 주요 기능 --
1. 입력 데이터 형식
- Affymetrix GeneChip Genotype Series (100k,500k,SNP5 CEL/CHP, GTYPE 추출 형식)
- ABI - TaqMan SNP Genotyping Assays (with Marker Information, SDS 추출 형식)
- Illumina Illumina Infinium BeadArray (BeadStudio 추출 형식)
- TAB-delimited Text Data (with or without Marker Information)
2. 데이터 전처리 (Allele / Genotype frequency, HWE Test, Monomorphic SNP flagging, etc.)
3. 연관 불평형 분석 (Haplotype Estimation, LD map drawing, LD Blocking, Tagging SNPs selection, etc.)
4. 연관 관계 분석 (Association Analysis with SNPs / Haplotypes)
- 5 가지 유전모델 적용 (Additive, Codominant, Dominant, Recessive, Overdominant)
- 각 유전 모델에 따른 Contingency Table, Statistics (chi-square, FDR, Fisher's exact p-value, permutation 등) 자동 실행
- LD map 에 유의한 SNP 자동 연동
5. Logistic Regression 을 이용한 판별 분석 (Clssification Analysis wth SNPs / Haplotypes)
6. 통계적으로 유의미한 SNP 에 대한 주석 정보 추출
-- 사용 환경 --
1. OS: MS Windows 2000/XP
2. CPU: Pentium4, 2.4GHz or higher
3. RAM: 1GB or higher (2GB recommended)
4. Internet connection (required for annotation data downloading)
본 정보는 "이즈텍" (으)로 문의 바랍니다.