GenPlex는 DNA칩 분석의 순서에 따라 Preprocessing, DEG Finding, Clustering, Classification등의 네가지 모듈로 구성이 되어있어 각 분석별로 최적화하여 구성하였습니다.
또한, 경쟁제품에 비해 가장 최근에 개발된 소프트웨어로 현재 수입되고 있는 외국 제품에 비해 비교적 최신의 분석 알고리즘이 탑재되어 있으며 특히, Dunnss index, Figure of merit(FOM)등은 군집분석(clustering analysis)를 최적으로 예측 할 수 있는 알고리즘으로 진플랙스에 유일하게 구현되어 있습니다. 또한 질병의 진단 에 많이 사용되는 판별분석(classification analysis)에서 지능형 알고리즘(whole computation technology)과 유전자사이의 상호관계를 이용한 주석시스템(BINGO)의 기술을 독자적으로 개발하여 탑재하여 외국 제품에 비해 월등한 경쟁력을 확보하였습니다.
구성 알고리즘
* 4가지 주요 분석에 대한 모듈화 분석 시스템:
Preprocessing, DEG finding, Clustering, Classification
* 칩 데이터의 분포나 직관적인 QC를 수행할 수 있는 다양한 통계 그래프:
Box plot, Histogram, MA plot, Sample correlation plot,
Volcano plot, Venn diagram
* 주요 클러스터링 방법과 뛰어난 그래픽 환경:
Hierarchical Clustering with average, complete, single linkage and
Ward method Dendrogram with superior graphic settings
K-means with automatic K value prediction
Self-organizing maps with U-matrix and Topographic cluster profiling
* 클러스터 결과를 평가할 수 있는 최신 통계 분석:
Generalized Dunn\\"s Index (GDI) for choosing best clustering results
FOM: Intelligent prediction for the optimal number of clusters
* 판별분석의 모든 단계를 한번에 수행할 수 있는 자동화 기능 및 최적 유
의유전자 유추:
All-in-one classification: Whole Computation technology
* 여러 각도로 회전하며 관찰할 수 있는 강력한 3차원 시각화 기능 제공:
Sample PCA with advanced graphics and functions
* 다양한 최신 생물학 정보 제공 및 데이터마이닝 기능
Gene Ontology annotation, KEGG pathway information
GO data mining: statistically over-represented GO terms in a gene group
** 제품 홈페이지에서 15일동안 모든 기능을 사용할 수 있는 체험판을 무료
로 다운로드 하실수 있습니다.
*** 제품 홈페이지 : http://www.genplex.co.kr/
*** 회사 홈페이지 : http://www.istech21.com/
*** 연락처 : 031-903-1155(T) / 031-903-1152(F) / genplex@istech21.com
[권장 사양]
** 운영체제 : Microsoft Windows XP/2000 or higher
** CPU : 1.8 기가헤르쯔 이상
** 메모리 : 1기가 이상
** Java Runtime Environment 1.5 이상
상세정보첨부 : GenPlex.PDF 참조