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서정민
서정민(Jungmin Seo) 저자 이메일 보기
(주)오믹시스
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조회 7061  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Genome-wide profiles of H2AX and γ-H2AX differentiate endogenous and exogenous DNA damage hotspots in human cells
1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드

세포에 방사선 조사시에 Double strand break와 같은 DNA damage가 일어나며, 히스톤 단백질 중 하나인 phosphorylated histone variant H2AX(γ-H2AX)에 대한 연구는 많이 있었으나 genome-wide study는 드물었습니다. 본 논문에서는 인간 유래 T cell과 암세포주를 이용하여 방사선 전후에 히스톤 단백질 중 하나인 H2AX와 인산화된 형태 γ-H2AX의 genome-wide profile을 차세대 시퀀싱 (next generation sequencing; NGS) 기술을 이용하여 작성하고 비교 분석하였습니다. 현재 epigenome에서 histone variant 연구를 주로 하고 있습니다.
2012년 Nucleic acid Research에 게재 결정이 되고, 최근 Faculty of 1000에 선정되어 감사합니다.

2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁 드립니다.

제가 소속된 기관은 생물정보분석과 관련실험을 같이 하는 ㈜오믹시스이며, 대전 한국생명공학연구원 내 벤처동에 위치하고 있습니다. 주로 생물정보데이터 분석과 NGS 관련 실험을 외부 연구원들과 공동연구로 진행하고 있습니다. PI이신 최정균 교수님은 대전 한국과학기술원 바이오 및 뇌공학과 교수님이시며, 김진성 박사님은 삼성의료원 소속이십니다. 연구에 참여하신 구성원들은 분자생물학, 세포생물학, 생물정보학, 통계학 등 다양한 전공을 가지신 분들로 구성되어, 다양한 의견을 교류할 수 있었던 것 같습니다.

3. 연구활동 하시면서 평소 느끼신 점 또는 자부심, 보람

아무도 해보지 않은 길을 가는 것은 고독한 일인 것 같습니다.
창의적 주제와 실험 전개 방법상에서 문제에 부딪힐 때가 많았는데, 스스로 해결하고자 하는 고민했던 부분이 힘들었지만, 개척 정신으로 앞으로 뚫고 나갔던 것 같습니다. 중간 중간 포기하지 않고 갈 수 있도록 밀어주신 여러분들이 생각납니다. 방사선 치료 후에 H2A.X의 인산화를 추적하여, 암환자처럼 방사선 치료가 필요하신 분의 경우, 조사 과정 후의 damage response를 보는 연구이므로, 방사선 치료를 받으시는 분들께 조금이라도 도움이 되리라 생각하고 연구활동을 할 수 있었고 보람이 있었습니다.

4. 이 분야로 진학하려는 후배들 또는 유학준비생들에게 도움이 되는 말씀을 해 주신다면?

저는 박사학위를 받은 지 10년이 넘었습니다. 박사후 연수과정에서 "생물정보학"을 접하였으며, 박사과정까지는 분자생물학을 전공하였습니다. 실험과 정보 분석을 두루두루 배웠던 것들이 많이 도움이 되었습니다. 후배님들도 생물정보학과 분자생물학을 골고루 배우면 좋겠습니다. 두 가지 토끼를 잡는 것은 어렵겠지만, 생물정보학 분야에서 생물 내 여러 현상들을 이해하고자 하는 공통 목적을 가진 생물학도들이 많이 도전했으면 합니다.

5. 연구활동과 관련된 앞으로의 계획이 있으시다면?

현재 T cell activation 전후의 H2AX profile 연구를 위하여 추가 실험을 하고 있으며, 또한 human epigenome 연구를 통하여, regulatory region에서의 variant analysis를 하기 위한 실험도 계획하고 진행 중에 있습니다.

6. 다른 하시고 싶은 이야기들....

먼저 급한 저의 성격을 잘 참아내시고, 이 연구가 가능하도록 격려했던 최정균교수님과 김진성교수님과 한국생명공학연구원 KOBIC 김상철 연구원께도 감사의 맘을 전합니다.
그리고, 저자 중에 성균관 대학교 강은숙 교수님과 손혜진 선생님께도 깊은 감사를 드립니다. 힘들 때 물심양면으로 지원해 준 남편에게도 고맙다는 말을 전하고 싶습니다.
 등록일 2012-08-06
Category: Biochemistry, Molecular_Biology
  댓글 4
회원작성글 kimsc77  (2012-08-16 17:46)
ㅊㄱㅊㄱ
회원작성글 반효정  (2012-08-17 10:31)
축하해요~!!!
회원작성글 김미랑  (2012-08-17 15:18)
박사님, F1000 축하 드려요. 저도 논문 자세히 읽어봐야겠네요.
회원작성글 기므기  (2012-09-15 15:50)
오~~ 서정민 박사님. 늦었지만 축하드립니다.
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