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조범식
조범식(Bumsik Cho) 저자 이메일 보기
한양대학교
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  CV updated 2020-09-13 11:22
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Single-cell transcriptome maps of myeloid blood cell lineages in Drosophila

1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드

이번 논문은 초파리의 조혈 기관인 Lymph gland를 single cell RNA sequencing이라는 방법을 이용하여 개별세포 수준에서 유전자 발현을 확인한 논문입니다. Single cell RNA sequencing은 기존의 ‘세포 집단’ 혹은 ‘조직’ 별로 유전자 발현을 확인하였던 bulk RNA sequencing 방법에서 벗어나 개별 세포 단위로 유전자 발현을 확인할 수 있다는 점에 있어 보고자 하는 생명현상에 대하여 깊게 연구할 수 있다는 것에 장점이 있습니다.

이번 논문을 통하여 저희 실험실은 기존까지 알지 못하였던 Lymph gland의 중간 간세포(Intermediate progenitor cell)의 마커 유전자를 찾을 수 있었고, 기존에 단일 그룹으로 알려져 있었던 progenitor cell을 세분화하여 줄기세포의 기능을 갖는 것으로 생각되는 세포를 찾았으며, 초파리 유충 혈구세포에서 말벌 감염 시 나타나는 유전자 변화, 서로 다른 발생학적 기원을 갖는 혈구세포 간의 유전자 차이에 관하여 실험 및 분석을 진행하였습니다. 초파리의 조혈기관이 연구된 지 오래 되지 않았기에 많은 부분이 아직 물음표로 남아있습니다. 따라서 이번 논문이 앞으로의 초파리 혈구 세포 연구에 있어서 도움이 될 수 있을 것으로 생각됩니다.

이번 논문은 한양대학교 남진우 교수님 연구실, 연세대학교 문석준 교수님 연구실, 하버드 의과대학의 Norbert Perrimon 연구실과 함께 공동연구 하였습니다. 우연한 기회로 많은 교수님들 그리고 박사님들, 대학원생들과 교류할 수 있었던 기회였기에 매우 뜻 깊은 논문이었습니다.

2. 연구를 진행했던 소속기관 또는 연구소에 대해 소개 부탁 드립니다.

저는 한양대학교 생명과학과의 심지원 교수님 지도 아래에서 실험을 진행하고 있으며 초파리 조혈기관의 분화 조절 매커니즘 연구, 혈구세포의 면역학적 기능 외의 새로운 기능 등에 초점을 맞추어 연구를 진행하고 있습니다.

3. 연구활동 하시면서 평소 느끼신 점 또는 자부심, 보람

연구라는 것이 언제나 신기하고 재밌으며 언제나 그 나름대로의 결과를 줍니다. 하지만 연구 자체가 자부심이나 보람을 준다기 보다는 제가 실험하고 이해한 것을 실험실 동료나 교수님 혹은 주변 사람들에게 이야기하고 그 것을 이해하는 동료의 모습을 볼 때 더 큰 보람 및 자부심을 갖게 됩니다. 지식은 갇혀 있는 것이 아니라 발산되는 것이라 생각합니다. 앞으로 저의 연구가 더 많은 발산이 있기를 바랍니다.

4. 이 분야로 진학하려는 후배들 또는 유학준비생들에게 도움이 되는 말씀을 해 주신다면?

이제와 돌이켜보니 대학원에 진학하려 했을 때 왜 박사과정이 진학하려 했는지 기억이 나지 않습니다. 왜 박사과정에 진학하려 하는지, 자신이 어떤 생물학적 궁금증이 있기에 대학원을 진학하려 하는지 생각해봤으면 좋겠습니다.

5. 연구활동과 관련된 앞으로의 계획이 있으시다면?

대학원 생활을 하면 할 수록 실험을 잘하고 머리가 좋은 사람들이 정말 많은 것 같습니다. 이러한 사람들 속에서 제가 할 수 있고 보람 있다고 생각하는 일은 저보다 더 실험을 잘하고 똑똑한 사람들을 위하여 기본이 되는 연구를 하는 것이라 생각합니다. 앞으로의 연구활동과 관련된 계획에 있어서 저의 연구가 바탕이 되어 다른 사람들에게 도움을 줄 수 있는 그런 연구가 하고 싶습니다.

6. 다른 하시고 싶은 이야기들....

이번 연구를 진행하면서 정말 많은 사람들을 만나게 되었습니다. 특히나 이번 연구를 함께 진행한 공동일저자 윤상호 학생에게 다시 한번 감사의 말을 전합니다. 상호의 도움이 없었다면 이 일은 처음부터 진행되기 어려웠을 것이라 생각합니다. 뿐만 아니라 하버드 대학의 박사 후 연구원인 Sudhir Gopal Tattikota 에게도 친구처럼 때론 선배처럼 저를 도와주어서 너무 감사하다고 전하고 싶습니다. 나아가 우리 연구실 구성원 모두와 논문을 지도해주신 저희 교수님, 남진우 교수님, Prof, Norbert Perrimon, Drop-seq 기계를 사용하게 해주신 연대의 문석준 교수님 그리고 기계를 같이 셋업 하였던 오수영 박사님께도 감사의 말씀을 드리고 싶습니다.

마지막으로 저희 부모님에게도 다시 한번 감사의 말씀을 드립니다. 감사합니다.

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좌측으로부터 심지원 교수님, 남진우 교수님, 윤상호 학생, 조범식 학생, Sudhir Gopal Tattikota, Norbert Perrimon.

Category: Genetics, Genomics
등록일 2020-09-25
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