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(주)툴젠 책임연구원 한국과학기술원 화학과 박사후과정
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Toward a Functional Annotation of the Human Genome Using Artificial Transcription Factors
1. 논문 소개

본 논문은 large-scale DNA microarray 를 이용하여 인간 유전자들을 expression profile 이 유사한 그룹끼리 grouping 하고 grouping 된 유전자 간의 기능적 유사성을 탐색한 논문입니다. DNA microarray 기술이 개발 되면서 밝혀진 사실 중 하나는 eukaryotic gene 들도 마치 E. coli 에서의 operon 과 같이 생체 내에서 유사한 기능을 수행하거나 공통의 biological pathway 에서 기능을 수행하는 유전자 간의 expression pattern 이 유사하다는 것입니다. 이러한 사실을 이용하여 다양한 condition 에서 expression pattern 이 유사한 유전자들을 grouping 하고 이를 통해 지금까지 기능이 알려져 있지 않았던 유전자의 기능을 유추하는 작업이 functional genomics 의 한 가지 방법으로 각광 받고 있습니다.

이러한 작업을 수행하기 위해서는 대규모의 DNA microarray 실험과 이의 분석이 요구되며, 또한 다양한 expression profile 을 얻기 위해 large-scale gene perturbation tool 이 필요합니다. 이 논문에서 저희는 저희가 보유하고 있는 다양한 specificity 를 가진 zinc finger-based artificial transcription factor 를 이용하여 random gene perturbation 을 유도하고 이를 통해 얻어진 132 개의 gene expression profile 을 분석함으로써 human genome 에서 약 500 여 개의 유전자들을 grouping 하였습니다.

2. 현소속 기관, 연구실 또는 Cornell University에 관한 소개

제가 박사 과정을 보낸 Cornell 대학교 생화학과 (지금은 molecular biology and genetics 로 변경됨) 에 대해서는 www.mbg.cornell.edu 홈페이지에서 자세하게 알아보실 수 있습니다. Cornell University 가 소재한 Ithaca 는 뉴욕 주의 한 가운데 위치한 인구 3만의 작은 도시로 조용하고 아늑한 분위기에서 연구에 몰두할 수 있는 곳입니다. (다른 의미로는 연구 외적인 면은 좀 지겨울 수도 있다.....는 얘기입니다…^^) 저희 과는 전통적으로 대학원생을 많이 뽑지 않았고 따라서 한국 학생도 거의 없었습니다만 현재는 한국 대학원생도 여러 명 있고 모두 매우 우수한 연구 성과를 보이고 있습니다. 학과의 분위기는 상당히 가족적이며 특히 대학원생들의 교육에 매우 중요한 비중을 두고 있어서, 박사 학위 과정을 하기에 아주 좋은 곳이라고 개인적으로 생각합니다.

3. 실험실에서의 연구생활 이야기 또는 외국에서의 연구생활 이야기

제가 미국에서 박사 학위 과정 중에 가장 힘들었던 점은 군대를 마치지 않고 유학을 갔기 때문에 만 27세 까지 학위를 마치고 귀국해야 한다는 부담감 이었던 것 같습니다. 물론 이러한 부담감이 더 열심히 연구를 할 수 있도록 채찍이 된 것도 사실입니다. 실험실에 join 하고 처음 2년간은 결과도 안 나오고 develop 하고자 하는 실험 method 가 계속 실패하여 많은 스트레스를 받았습니다. 결국 그것을 돌파하기 위해 제가 쓴 방법은 (우습지만) 한달 간을 학교에서 밤을 새워 일했습니다. (새벽에 새우잠을 자고 집에 가서 씻고 다시 나오는 식으로) 그게 도움이 됐는지는 모르겠으나 어쨌든 그 과정에서 돌파구를 찾아서 학위 과정 중에 좋은 논문을 쓸 수 있었습니다.

학위를 받고 한국으로 귀국해야 하는 상황 또한 제게는 여러 가지로 힘든 부분이었습니다. 주위에 유학 나온 친구들 중 다수가 편법 혹은 불법으로 귀국하지 않고 미국에 계속 체류하는 모습을 보며 고민도 많이 했습니다만, 결국 한국에 돌아와서 5 년간 전문 연구 요원으로 일하게 되었고, 이 과정에서 온 가족이 이산 가족이 되는 어려움도 있었습니다만, 내년 3월에 복무 만료 예정인 이 시점에서는 올바른 선택이었다는 생각이 듭니다. (음....그래도 5년은 좀 길고, 4년이면 할 만 할 것 같습니다만.... 더 줄어야 되겠죠? ^^)

4. 과학자를 희망하거나 유학을 준비하는 후배 연구자에게 조언을 하신다면?

연구 과정도 그렇고 유학 준비도 마찬가지 입니다만 힘들고 고통스러운 부분들이 많이 있습니다. 그럴 때 일수록 궁극적인 목표를 이루기 위한 과정이라고 생각하고 이겨 나가시기 바랍니다.

5. post-doc 및 (박사 진학에 관심있는) 석사급 연구원을 모십니다

광고 하나 하겠습니다. 저는 2004년 3월부터 포항공대 화학과 생화학 전공 조교수로 부임할 예정입니다. 고등 동물 세포의 유전자 발현 메커니즘 이해, 다양한 분자 생물학 도구를 이용한 functional genomics, large-scale DNA microarray (가까운 장래에 Affymetrix GeneChip system 을 갖출 계획입니다) 실험을 통한 systems biology 및 small chemical target prediction 등에 관심 있는 post-doc 및 (박사 진학에 관심있는) 석사급 연구원을 모시고자 합니다. 관심 있는 분들의 연락을 기다리겠습니다.



Received for article November 24, 2003

 등록일 2003-11-24
Category: Genomics
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