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Blast2Go를 이용한 ontology 분석에 대해 궁금한것이 있어 글 남깁니다
지히
(2014-12-10 17:33)
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안녕하세요?
다름이 아니라 blast2go를 통하여 ontology 분석시
annotation 뒤 annotation chart에서 볼 수 있는 Direct GO count 와
combined graph를 한 뒤에 나오는 GO(level별로 볼수 있는..)와 어떤 차이가 있는지 궁금해서 질문을 남깁니다.
통상 GO같은경우 한개의 유전자가 여러개의 GO 에 붙어 중복성이 있는것으로 알고 있는데, 혹시 Direct GO count의 경우는 이를 배제한 것인가요?
그런경우 어느 데이터를 사용해야 신뢰도가 높은지도 궁금합니다...
어의 없고 초보적인 질문일지도 모르겠지만, 혹시 아시는 선생님들이 계시면, 답변 꼭 부탁드립니다..
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