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이곳에 질문하는 것이 맞는 것인지 모르겠습니다.
회원작성글 kyle3012
  (2014-11-25 15:47)
 공감0   조회5346  인쇄  주소복사  소셜네트워크로 공유하기

내년에 석사 시작하는 석사 준비생입니다.
NCBI BLAST를 통해 서로 다른 mRNA를 비교하는 것인데
같은 gene에서 나온 isotype입니다. exon의 차이가 다른 것이라 생각되어지지만
어떻게 다르고 차이가 있는지 다가가기가 쉽지 않습니다.
도와주십시요.
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클로닝의 역습  (2014-11-25 15:55)
공감0  비공감0   수정 삭제
흠. mRNA variant에 따른 isoform찾을 때 저는 주로 expasy씁니다. expasy에서 Uniprot으로 특정 protein을 검색하면 그 protein의 isoform에 따라 alternative splicing이 어떻게 일어난 것인지에 대한 정보가 나옵니다. NCBI blast는 partical Cds로 해당 유전자&단백질 찾을 때 쓰긴 합니다...

구. 소리마당
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