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Short hairpin RNA (shRNA) – II 편
서린바이오사이언스
※ shRNA Controls Product Line
(1) GIPZ Control
Product Description |
Size/Format |
Cat No. |
|
Positive Control |
GIPZ GAPDH Lentiviral shRNA Positive Control |
Glycerol Stock |
RHS4371 (H,M) |
GIPZ GAPDH Lentiviral shRNA Positive Control |
Viral Particles |
RHS4372 (H,M) |
|
GIPZ EG5 Lentiviral shRNA Positive Control |
Glycerol Stock |
RHS4480 (H,M) |
|
GIPZ EG5 Lentiviral shRNA Positive Control |
Viral Particles |
RHS4584 (H,M) |
|
Negative Control |
GIPZ Lentiviral Empty Vector |
Glycerol Stock |
RHS4349 (H,M) |
GIPZ Lentiviral Empty Vector |
Viral Particles |
RHS4351 (H,M) |
|
pSM2 Retroviral Empty Vector |
Glycerol Stock |
RHS1704 (H,M) |
|
pSMP Retroviral Empty Vector |
Glycerol Stock |
RHS4973 (H,M) |
|
GIPZ Non-silencing Lentiviral shRNA Control |
Glycerol Stock |
RHS4346 (H,M) |
|
GIPZ Non-silencing Lentiviral shRNA Control |
Viral Particles |
RHS4348 (H,M) |
* TurboGFP reporter gene과 puromycin-resistance 포함
(2) TRIPZ Inducible Lentiviral shRNA Control
Product Description |
Size/Format |
Cat No. | |
Positive Control |
TRIPZ GAPDH Inducible Lentiviral shRNA Positive Control |
glycerol stock |
RHS4744 (H) |
TRIPZ GAPDH Inducible Lentiviral shRNA Positive Control |
viral particles |
RHS4930 (H) |
|
Negative Control |
TRIPZ Inducible Lentiviral Empty Vector |
glycerol stock |
RHS4750 (H) |
TRIPZ Non-silencing Inducible Lentiviral shRNA Control |
glycerol stock |
RHS4743 (H) |
|
TRIPZ Non-silencing Inducible Lentiviral shRNA Control |
viral particles |
RHS4827 (H) |
* TurboRFP reporter gene 포함
(3) SMARTvector (Inducible) Lentiviral Control
Type |
Gene-based |
Non-targeting (Control 1~12) |
Positive control |
negative control |
|
species |
Human, mouse, rat |
|
gene |
GAPD, PPIB |
– |
Promoter |
– hCMV, hEF1a, mCMV, mEF1a – Inducible: PGK, hEF1a, mCMV, mEF1a |
|
Reporter |
TurboGFP, TurboRFP |
|
Inducible expression |
● |
|
Format |
Glycerol stock, Lentiviral particles |
* SMARTvector Non-targeting Control 1: 가장 일반적으로 사용되는 control로 몇 개의 gene을 포함하는 실험에 적합
** SMARTvector Non-targeting Control 2~12: screening 실험에서 여러가지 non-targeting control을 사용해야하는 실험에 적합
*** Empty vector 구매 가능
**** Non-targeting Control 4-Pack
: 특정 cell에서 가장 활성을 보이는 promoter 결정 가능
PGK, hEF1a, mCMV, mEF1a 가 포함된 각 SMARTvector Inducible Non-targeting Control
(4) TRC control
Product description |
Size/Format |
Cat No. | |
Positive Control |
TRC Lentiviral eGFP shRNA positive control |
glycerol stock |
RHS4459 (H,M) |
Negative Control |
pLKO.1 Empty Vector |
glycerol stock |
RHS4080 (H,M) |
TRC Lentiviral Non-targeting Control |
glycerol stock |
RHS6848 (H,M) |
A. 실험 디자인
일반적으로 실험 디자인을 할 경우, 4가지 sample을 한꺼번에 test
|
B. 실험 결과
1) shRNA의 effect는 RNA level에서 확인 필수 (qRT-PCR 결과 필요) 2) cell이나 gene의 종류에 따라 knockout 시간이나 정도의 차이가 있을 수 있음 (protein level을 western blot으로 확인할 경우, transfection 후 시간이 48hr이기 때문에 이미 mRNA를 통해 만들어진 protein이 남아 있을 확률이 높음) ⇒ 처음 실험한다면 반드시 mRNA를 측정해야 정확한 knockdown 확인 가능 3) Sequencing 각 Clone 별 Target sequence가 정확히 있는지 확인하는 과정 (3개 clone 이상) – shRNA의 3개 clone 중 1개의 shRNA는 mRNA level 을 최소 70% knockdown 시키는 것을 보장 (셋 중 한 개 shRNA 만이라도 Knockdown effect를 나타낼 경우, 나머지 shRNA에 대해서는 guarantee 불가) |
본 정보는 "서린바이오사이언스" (으)로 문의 바랍니다.