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[엠지아이테크코리아] Spatial Transcriptomic 기술 (STOmics application) 소개
제품(기술)분류: Bio_Resource > Bio_Chip
전화: 01082859905
메일: yunjaeyoung(at).mgi-tech.com
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상세정보 사용후기 회사정보 |  등록제품
  카탈로그 NO :
  제품 생산일 : 2022.01
  원산지 :
  생산기업 :
  특징 및 규격  

BGI 연구팀이 자체 개발한 Stereo-Seq(SpaTial Enhanced REsolution Omics-Sequencing) 기술은 RNA 추출 없이 in situ capturing 방식을 통해 공간 전사체 분석 즉 조직 내 세포의 위치 정보와 조직내 세포간의 상호 작용 및 유전자 발현 정보를 동시에 분석할 수 있는 기술입니다. DNB(DNA Nanoball) 기술을 기반으로 하는 Stereo-Seq은 나노 스케일 해상도와 panoramic View, comprehensive한 정보를 제공할 수 있어 공간 전사체 분석에 있어 새로운 기술을 연구원들에게 제공할 수 있게되었습니다. 

 

 BGI STOmics

1. STOmics-GeneExpression-S1 Workflow

STOmics Workflow

 

Application Example

Application Example: Visualizing Whole Mouse Embryos and Adult Mouse Brains Through Stereo-Seq

STOmics-GeneExpression-S1 Chips are patterned grids of probes containing spatial coordinates. Upon interaction with a tissue section, cDNA is synthesized in situ from mRNA captured by the chip probes. Sequencing the cDNA with their spatial coordinates allows in silico reconstitution of the spatial transcriptomic profile of the tissue section, allowing easy visualization and analysis.

STOmics-GeneExpression-S1 resolves the developmental structure-specific gene expression patterns in mouse embryos at centimeter-scale fields of view. A. Hematoxylin and eosin staining of an E16.5 embryo section. B. Unsupervised clustering analysis identifies different anatomical structures in the E16.5 embryo. C. Spatial expression heatmap of the indicated genes representing different developing structures in an E16.5 embryo section.

Recent Publications

Spatiotemporal Transcriptomic Atlas of Mouse Organogenesis Using DNA Nanoball Patterned Array (사진을 클릭하시면 자세한 내용을 보실 수 있습니다)

High-resolution Spatiotemporal Transcriptomic Maps of Developing Drosophila Embryos and Larvae

Spatiotemporal Mapping of Gene Expression Landscapes and Developmental Trajectories During Zebrafish Embryogenesis

Single-cell Stereo-seq Enables Cell Type-specific Spatial Transcriptome Characterization in Arabidopsis Leaves

Spatiotemporal Transcriptome at Single-cell Resolution Reveals Key Radial Glial Cell Population in Axolotl Telencephalon Development and Regeneration

Spatially-resolved Transcriptomics Analyses of Invasive Fronts in Solid Tumors

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