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[별별소리] MTT assay-Doubling time 값 (Log값과 Curve값 차이)
캘리그라피
  (2019-07-23 13:39)
 

안녕하세요?

제가 Proliferation assay 중 MTT assay를 진행하는데 Cell의 Doubling time 값에서

Log값과 Curve값 차이가 납니다. 이럴 경우 어떤 값으로 해야 할까요?

제 생각에 Log값이 계산 공식으로 나온 값 (기울기)이라 더 객관적일 것 같은데,, curve 값이 더 그럴듯할 때도 있습니다. 예를 들어 day3 (72h)에서 세포 MTT 흡광도 (at 544nm)가   Log값은 40h, Curve값은 75h 나오면 Curve값이 비슷하다고 볼 수 있습니다. 하지만 두 값의 차이가 나는 것은 뭔가 문제가 있는 것 같아서,, 조금 헷갈립니다. Curve값은 비슷할지라도 2배되는 지점을 찍는거라 주관적이라 생각합니다..

http://www.doubling-time.com/compute_more.php

위의 사이트에서 0,2,3,4day or 0,48,72,96h 각각의 흡광도 측정값을 넣고 값을 얻었습니다.

upload_image

Doubling Time

-Log =3.82days=ln(2)/0.1816=91.68h (계산 식=durationlog(2)log(FinalConcentration)log(InitalConcentration))

-Curve =3.2days=76.8h

Growth Rate = 0.1816

Growth Rate = number of doublings that occur per unit of time

Equation : amount=1.1542*e0.1816*time

At t=0, calculated cell concentration = 1.1542

 

이 사이트의 reference를 보면 대부분 log값으로 계산식에 값을 넣어서 했더라고요.. 그냥 이 계산식의 값이 doubling time 맞겠죠?? 다른 실험실에서 MTT assay를 이용한 데이터 분석 어떻게 하시는지 궁금하고,, doubling time  값을 이렇게 애매한 경우 log값으로 하는게 맞는지 알고 싶습니다.. 감사합니다.



태그  #doubling time   #MTT assay   #Proliferation assay
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