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[진로] 생물정보학(Bioinformatics)을 공부하고자 하는 학부생입니다
회원작성글 BCH꿈나무
  (2019-05-21 00:16)

진로도 마찬가지로 생물정보학을 전공하고 싶기에 많이 늦은감이 없지않아 있으나 지금부터라도 공부해보려고 합니다.

 

그래서 제가 현재 사용하고자 하는 프로그래밍 언어로 R과 Python 두 가지 중에 선택해서 공부해보려고 하는데 두 프로그램이 사실상 딥러닝, 머신러닝, 데이터 마이닝 등 굉장히 다양한 분야에서 사용되고 있기때문에 어디서부터 공부를 시작해야할 지 감이 전혀 오지를 않습니다.  

코딩이나 프로그래밍 언어 관련된 부분에 대한 지식은 전혀 없는 상태인데 어떻게 공부를 시작하는 게 좋을까요? 조언 부탁드립니다 ㅠㅠ

 



태그  #Bioinformatics   #R   #Python
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  댓글 6  
회원작성글 꺼진불도다시보자  (2019-05-21 09:59)
1
R, Python은 기존 프로그래밍에 비해 접근이 그래도 쉬워서 background가 없어도 그나마 배울만 하지요
일정 돈을 투자해서 배우려면 강의하는 사이트는 많이 있구요 (mooc활용 혹은 datacamp등의 일반 강의 업체, 1년 10만원정도?) 다양한 코스를 제공하고 있습니다.
가능하면 공부하다 막혔을때 조언정도 해줄수 있는 주변인이 있으면 좋고, 아니면 bioinformatics를 하는 실험실에 컨택해서 학부연구생으로 들어가 감을 잡는것도 방법입니다.
제 경험상 본격적으로 분석을 시작하게 되면 결국 R과 Python을 둘다 사용하게 됩니다. 차근차근 배워보세요
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회원작성글 BCH꿈나무  (2019-05-23 18:59)
2
아하 그렇군요!! 결국엔 둘 다 사용하게 된다니.... 답변 감사합니다!!
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회원작성글 hryankim  (2019-05-21 23:42)
3
네 저도 오래 전에 했던 고민이네요. 프로그래밍 랭귀지를 선택하는 것에 대해서 제가 조언을 들은 것은 다음과 같습니다. NYU의 고 Robert Dewar 교수님은 모든 랭귀지는 다 툴이고 네가 하고자하는 것을 가장 정확하게 그리고 편하게 구현 할 수 있는 것을 선택하라고 조언해주셨습니다. Yann LeCun 교수님 (지금은 facebook에 겸직하시는 AI 대가)께서는 아예 lush라는 프로그래밍 언어를 만들어서 쓰십니다. Matlab이나 R은 자신이 구현하고자하는 수학적 아이디어를 구현하기는 쉽지만 너무 느리다는 단점이 있다고 하셔서 저도 한동안 lush를 쓰면서 교수님의 수업을 들었었네요. 일단 가장 많이 쓰는 언어로 기본을 배워보시고 쓰다보면 자신이 편한 쪽을 찾아가시라고 후배님께 조언드립니다. bioinformatics를 전공하려한다면 오히려 생물학 좁게는 genomics쪽에 개념을 잘 공부하시고 어떤 data들이 존재하고 어떤 분석들이 가능한지 또 그것을 자신의 pipeline 만들어보는 훈련을 통해 프로그래밍을 공부하시는 것이 제 경험으로는 가장 좋은 방법일 것 같습니다. 그리고 더 중요한 것은 statistics에 대한 확실한 기반을 만들어주시면 좋겠네요. 점차 data science를 접목시키기 위해서는 기본인 것 같습니다. 도움이 되셨기를 바랍니다.
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회원작성글 BCH꿈나무  (2019-05-23 19:02)
4
상세한 답변 감사합니다!! 저 역시 프로그래밍 뿐만 아니라 기반 genomics에 대해서도 사실 크게 알고 있는 부분이 없어서 고민이였는데 아직 배워야할 것들이 정말 많네요
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회원작성글 pest  (2019-05-23 00:03)
5
생물 정보학을 하시려면 언젠가는 R, python 둘 다 하셔야 할 겁니다. 그런데 python이 훨씬 더 범용으로 쓰이기 때문에 python을 먼저 배우시는 게 낫습니다.

R을 필요한 정도로만 익히는 건 대부분의 경우에 아주 쉽습니다. 저도 R은 꽤 한다고 자부하는데, 대부분은 연구에 필요에 따라서 구글 검색해 가면서 익혔습니다.

일단 python을 확실히 익히기를 추천드립니다.

생물정보학적인 방법론을 개발하는 컴퓨터장이가 되기를 원하시면 코딩 및 전산학을 제대로 깊이 공부하셔야 할 것입니다.
그게 아니라 이미 개발된 생물정보학적인 방법론을 통해서 데이터를 대용량으로 처리하는 것에 관심이 있다면 생물정보학과 관련된 python 예제부터 하나씩 경험하게 해 주는 책 혹은 강좌가 빠를 것 같습니다.
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회원작성글 BCH꿈나무  (2019-05-23 19:04)
6
답변 감사합니다!! 그러면 범용으로 쓰이는 python을 먼저 배운후에 R을 공부하는 것이 더 낫겠네요!!
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