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[학술] reference genome 어떤거사용해야하는지에대한
회원작성글 9512ewq
  (2019-02-19 18:56)
https://my.pgp-hms.org/public_genetic_data 
여기에있는 Bam. 파일들이 어떤 genome Reference (hg19? hg20?)인지에 대해서 매핑되어있는지 알려면 어떤작업을 거쳐야하나요?  관련정보가 없어서 질문드려요 


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  댓글 2  
회원작성글 TransBio  (2019-02-19 23:47)
1
bam file header 를 보세요. samtools view -H xxx.bam 하고 @SQ 라인을 보시면 reference sequence 정보가 있습니다
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회원작성글 9512ewq  (2019-02-20 15:07)
2
감사합니다!
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