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[우당탕탕 석사 적응기] 석사 1학기 - 새로운 환경, 그리고 후회
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[진로] 생물정보학 (bioinfomatics)에 대해 궁금합니다!!! 도와주세요!!
회원작성글 jw1129(일반인)
  (2022-08-13 14:55)

안녕하세요. 곧 제대를 하고 학부 3학년으로 복학하게될 생명과학과 학부생입니다. 앞으로 진로를 생물정보학쪽으로 나아갈려고 합니다. 고등학교때부터 생물학에 관심이 있었던지라 한국 바이오산업의 어려운 실정에 대해 잘 알고 있습니다. 또한 그에 따라 생물학에 대한 자기확신과 의지가 필요하다고 생각해서 생물정보학에 대해 나름대로 알아보고 있습니다. 하지만 10년 전 작성된 글이거나 글마다 다른 내용 때문에 정확한 정보를 찾는 게 힘들더라구요. 아직 전문적인 지식이 없어서 좋은 질문이 아닐 수 있는 점 양해부탁드립니다.

 

1. 생명과학과 출신 생물정보학자가 딥러닝까지 배우는 것이 현실적으로 가능한가요? 생물, 소프트웨어, 통계학을 공부해야하는 상황에서 딥러닝 기술까지 갖춘 현직자들이 많은지 궁금합니다. 석사까지는 확정적으로 생각하고 있고 박사는 석사를 하면서 더 생각해볼려고 합니다. 또한 cs출신들이 바이오를 배워서 바이오 인포쪽으로 유입된다던데, 한국 바이오 기업이 생물정보학 전공자와 바이오를 공부한 cs전공자 중 어느 전공자를 더 선호하는 지 궁금합니다.

 

2. 현재 프로그래밍을 독학하고 있습니다. python의 라이브러리(numpy, pandas)를 공부하고 있고 R, SQL의 기초를 공부하고 있습니다. 혹시 독학할 책이나 강의 추천해주실 수 있나요? 가능하다면 딥러닝까지 공부할 거 같습니다. 혹시 생물정보학 전공자 중에 딥러닝을 공부하고 계신 분이 있다면 조언 부탁드립니다.

 

3. 앞서 얘기했듯 바이오분야가 자기확신이 중요하다는 걸 알지만 경제적인 부문을 생각을 안 할 수 없는 거 같습니다. 한국 대학원 석사 기준 한국 내 생물정보학 전공자의 수요와 앞으로의 구체적인 한국의 바이오인포 전망이 궁금합니다. 유망한 분야인건 알지만 학계와 산업은 달라서 말이 다른 경우를 많이 볼 수 있는 거 같습니다. 연봉 수준이 궁금합니다. (석사기준입니다.)  

 

4. 석사는 확실히 할려고 합니다. 근데 미국으로 석사때부터 유학을 가시는 분들이 많은 거 같아요. 현재 한국 대학원을 생각하고 있고 더 공부를 하고 싶다면 미국 박사 유학을 생각해볼려 합니다. 혹시 한국 대학원 출신이 미국 취업을 하는 경우가 많은지 궁금합니다. 한국 대학원 출신이 미국 취업이 힘들면 미국 박사 유학을 적극적으로 생각해볼려고 합니다. 아무래도 미국 유학비를 감당하기 부담스러워서 가능하면 한국 대학원을 나올려고 합니다. 

 

감사합니다!!

 


태그  #생물정보학   #바이오인포매틱스   #bioinformatics
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  댓글 18  
회원작성글 크옷(과기인)  (2022-08-14 09:32)
1
안녕하세요. 음 저는 bioinformatics 전공은 아니었고, molecular biology 를 하다가 필요에 의해 주섬주섬 genomics, bioinformatics 를 배우면서 한창 연구를 하다가, 지금은 순수 프로그래머들과 생물하시는 분들 사이의 다리를 놓는 역할 (?) 로 해외에서 직장을 다니고 있습니다.

제가 한국에서 학부, 대학원 다닐 때 아직 bioinformatics 학과도 연구실도 없었지요. 한국 떠날 때쯤 한 두개씩 연구실이 생기기 시작하더군요. 지금 한국 상황은 어떤지 모르겠네요.

프로그래밍 독학도 좋고 딥러닝 공부도 좋지만, 가장 중요한 것은
- 본격적으로 박사 유학까지 하면서 연구를 하고 싶다면: bioinformatics 가 현재 어떤 큰 질문들을 해결하려고 하고 있는지,
- 석사 정도까지 마치고 취업을 하고 싶다면: 회사 등에서 원하는 bioinformatics 업무들은 어떤 것이 있는지,
- 무엇보다 나는 무엇이 궁금하고 무엇 (분야?) 을 하고 싶은지,

... 가 중요하다고 생각합니다.

지금 공부하시는 도구들 이외에 생물학, 통계/data science, 영어 공부도 게을리하지 마시길 바라고, 그냥 공부하기보다는 끊임없이 내 자신이 무엇이 궁금한지 무엇을 하고 싶은지 생각하시면 좋겠습니다. 막연히 생물학/bioinformatics 보다는 조금이라도 분야를 좁힐 수 있으면 공부하기도 쉽겠지요.

한국 사정은 잘 모르겠지만, 해외로 나오는 것도 생각하고 계시다면 요런 기사를 함 보세요:
https://www.northeastern.edu/graduate/blog/top-bioinformatics-careers/
이 기사에서는 genomics 를 주로 다루고 있는데, 그외 image processing 이나 (요즘 한창 인기인 단백질 구조를 포함해서 온갖 것들의) 모델링 등 전혀 다른 bioinformatics 분야도 있겠습니다. 연봉 등은 석사를 기준으로 한 것 같은데, 사실 computer engineering 전공보다는 bioinformatics 연봉이 적은 편입니다. 특히 학계라면 ... 연봉보다는 하고 싶은 연구 한다는 보람이겠지요.

페이스북이나 트위터를 하신다면 요런 community 에 가입해보시는 것도:
https://www.facebook.com/groups/114438911960536
https://twitter.com/i/communities/1506791236987879425

또한 트위터를 하신다면 이런 분들을 follow 하고 이분들 연구실에서 무엇을 하는지 살펴보세요 (이분들과 다른 연결된 분들의 Google scholar profile 을 follow 하는 것도 좋습니다). 이분들부터 시작해서 연결되어 있는 다른 분들도 follow 해보면 좋겠네요. (역시 분야가 genomics 쪽으로 치우쳐 있지만 제가 아는 게 그쪽이어서...):
https://twitter.com/lpachter
https://twitter.com/StevenSalzberg1
https://twitter.com/mikelove
https://twitter.com/lh3lh3
https://twitter.com/mike_schatz
https://twitter.com/BenedictPaten
https://twitter.com/aaronquinlan
https://twitter.com/thesteinegger

https://twitter.com/SueRhee2
https://twitter.com/Eric_Fauman
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회원작성글 jw1129(대학생)  (2022-08-14 19:25)
2
좋은 말씀 감사합니다. 앞으로 더 연구하기 위해서 공부도 중요하지만 자신이 하고 싶은 연구를 찾는 것이 중요한 거 같습니다. 그래야 목적성도 생기고 공부할 분야도 좁혀지기 때문이겠죠.
또 올려주신 기사와 커뮤니티 링크도 큰 도움이 되었습니다. 특히 저랑 비슷한 상황의 학부생들도 있어서 제 상황에 맞는 조언을 얻은 거 같습니다. 아직 전문지식이 없어서 더 많은 내용을 살피기 힘들었지만 앞으로 공부하면서 주신 링크 많이 참조하겠습니다. 덕분에 오늘도 공부할 힘이 생기는 거 같네요. 감사합니다!!
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회원작성글 크옷(과기인)  (2022-08-15 03:20)
3
또한 Bioinformatics 분야에서 나오고 있는 job posting 들을 검색해서 관심 가는 것들을 자세히 읽어보는 것도 도움이 되리라 생각합니다. 어떤 qualification 을 원하는지, 어떤 project 를 수행하기 위해 사람을 어떤 형식으로 뽑는지, 학계와 산업계 (?) 는 어떻게 다른지 등등.

Generic 한 job posting 보드:
https://jobs.sciencecareers.org/jobs/bioinformatics/
아마 국내에서도 job posting 이 이루어지는 보드가 있겠지요 (Bric?). 위에 링크해드린 Korean Bioinformatics 페북 페이지에도 간간히 잡 포스팅이 올라왔던 것 같기도 하구요.

그 외 구글 서치로 관심이 있는 기관이나 회사의 "Careers" 페이지에 가서 들여다보셔도 좋구요.

글 쓰신 분께서 공부를 마치고 잡 마켓 나올 때쯤이면 여러가지 바뀔 수 있으니까, 주기적으로 한번씩 들여다보면 좋겠네요.
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회원작성글 jw1129(대학생)  (2022-08-15 15:00)
4
이번에 주신 링크에는 포닥을 채용하는 구직내용이 많네요. 포닥은 해당 연구의 전문지식과 프로그래밍 스킬을 많이 요하는 거 같네요. 포닥이 아닌 경우에는, 여러 연구를 지원하는 직무가 보이는데 여려 연구의 통계데이터를 분석할 수 있는 사람을 필요로 한 거 같아요. 연구 주제는 단백질체학, 유전체학, 대사체학이 많이 보이네요. 이렇게 또 정보를 주셔서 감사합니다 ㅠㅠ
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네이버회원 작성글 안녕***(비회원)  (2022-08-15 11:24)
5
그냥 데이터사이언스로가세요 바이오인포매틱스는 정보도 거의없고 공부할소스도 그렇게 많지가 않습니다..
채용공고수도 훨씬적구요. 어차피 둘다 통계, PYTHON 열심히 배워야되니까. 그냥 데이터사이언스 배우시고. 바이오인포매틱스로 가고싶다하면 그때 추가적으로 지식을 쌓던 뭘하던. 어찌됬든 바이오인포쪽도 경력직만뽑는 시장이라.
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회원작성글 jw1129(대학생)  (2022-08-15 15:03)
6
그렇군요...혹시 데이터 분석 관련 통계 공부할 수 있는 곳 있나요? 강의나 책이요. 아니면 데이터 분석에 필요한 통계 과목의 종류는 어떤 것들이 있을까요? 선형대수 같은 거요. 다른 건 책이나 프로그램이 많은데 데이터 분석에 대한 통계 수학 관련해서는 좋은 소스가 없는 거 같아서요ㅠ
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네이버회원 작성글 안녕***(비회원)  (2022-08-15 11:25)
7
생명과학과 출신이라서 무조건 그걸 연관지어서 취업해야지! 하는 순간 골머리가 아파집니다.
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회원작성글 pest(과기인)  (2022-08-16 07:59)
8
딥러닝이라..

Supervised Learning이나 unsupervised Learning 같은 건 생명과학 출신이 어찌해 볼 수 있을 것 같긴 한데, 딥러닝은 컴퓨터 전공자의 영역이 아닌가 싶습니다. 아직 딥러닝은 바이오인포에서 많이 쓰이지는 않는 것 같습니다. 바이오인포 하는 사람 중, 딥러닝하는 사람은 거의 없을 겁니다. 있다고 해도 CS 출신이 꽉 잡고 있을 겁니다.

그런데 독학만으로 어떻게 해보겠다는 건, 사실 절대 비추입니다.. 제대로 공부히기도 힘들거니와, 자기 실력이 좋다는 걸 입증할 방법도 없습니다. 최소한 대학에서 학점은 따야 이 사람이 뭐라고 했구나 하고 믿어주는 세상입니다. 아직 학부생이니, 일단 대학교 수업을 좀 들으시는 게 어떨까요?

바이오인포도 정말 분야가 넓으니, 석사를 하면서 장래 진로에 대해서 생각을 해 봐도 될 것 같습니다. 아직은 그냥 뜬구름 잡는 얘기 뿐일 것 같습니다.
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회원작성글 jw1129(대학생)  (2022-08-17 20:45)
9
좋은 조언 감사합니다. 자기 실력을 입증할 방법이 없다는 거에 크게 공감합니다. 그래서 다음 학기에 컴공이나 데이터 전공을 부전공하거나 바이오소프트웨어를 융전해볼 생각입니다. 대학원 진학시에는 기계학습을 같이 연구하는 바이오인포 연구실을 들어갈 계획입니다. 바이오인포관련 채용에서 AI를 할 수 있는 바이오인포를 요구하는 것을 볼 수 있는데, 이 경우 딥러닝이 아니라 지도 학습 정도 수준을 요구하는 거 같네요.
현재로서는 커져가는 바이오인포 시장에서 툴 개발이나 AI신약개발 쪽으로 가고 싶습니다. 아직 잘 몰라서 섣불리 결정할 수도 있을 거 같아 걱정됩니다. 혹시 바이오인포의 여러 분야나 앞으로 국내 바이오인포 시장 전망에 대해 조언해주실 수 있나요? 책이나 뉴스에서는 드문드문 보이는데 현직자의 시각이 너무 궁금합니다.
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회원작성글 shuffle(대학원생)  (2022-08-16 15:50)
10
정확히 어떤 연구를 하고싶은지에 대해 곰곰히 생각해보시는게 좋을 것 같습니다. 막상 비슷한 연구라고 생각되어 진로를 결정했음에도 불구하고 현실은 변수가 꽤 많은 것 같습니다.
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회원작성글 jw1129(대학생)  (2022-08-17 20:48)
11
좋은 조언 감사합니다. 다들 같은 조언을 해주시는 거 같아요. 연구 분야를 세부적으로 정해야하는데, 쉽지 않네요...현재로선 툴 개발이나 AI신약개발 중 후보물질 도출 관련 연구를 하고 싶습니다. 혹시 조언 부탁드려도 될까요?
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회원작성글 PokyNMR(과기인)  (2022-08-23 07:42)
12
저는 GIS 개발자에서 구조생물학 / 생물정보학 / NMR 쪽으로 전공하게된 케이스입니다. 한국에서 석사 후, 미국에서 지내고 있습니다. 궁금한 것 있으시면 이메일 보내주세요.
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회원작성글 해피쿠키(대학원생)  (2022-08-23 16:00)
13
생물학과 학부출신에 머신러닝기반으로 biomedical informatics 연구하고 있는 학생입니다. 3학년이시면.. 우선 CS학생들이 배우듯이 머신러닝, 딥러닝 수업 혹은 독학 (온라인 메테리얼 매우 많습니다) 으로 공부해보세요. 입문 후에 더 고민해보셔도 충분합니다.
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회원작성글 jw1129(대학생)  (2022-08-24 18:17)
14
혹시 머신러닝은 어떻게 공부하셨나요?
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회원작성글 해피쿠키(대학원생)  (2022-08-25 12:55)
15
혼자 온라인강의보면서 공부했습니다. 필요한 prerequisite 과목도 혼자 인터넷에 있는 강의나 책보고 했어요. (프로그래밍이나 선형대수)

혹시 더 필요하신정보있으시면 메일주세요
happicukki@gmail.com
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회원작성글 jw1129(대학생)  (2022-08-25 17:29)
16
메일 드렸습니다!
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회원작성글 Sshhh(대학생)  (2022-09-15 12:24)
17
저는 국비지원 들었는데요, 수업 듣고 팀원들이랑 프로젝트 하는 형식이라 프로젝트 밤 새가면서 하는 동안 실력이 많이 늘었어요! 국비지원도 고려해보세요
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카카오회원 작성글 이승*(비회원)  (2022-09-22 18:06)
18
안녕하세요! 저 또한 바이오인포에 관심이 생겨 조언글을 찾던 도중 해당 글을 읽고 댓글을 달게 되었습니다. 이 글의 작성자는 아니지만 국비지원에 대한 이야기를 해주셨는데 혹시 어떤 국비지원인지 알 수 있을까요? 저 또한 국비지원 등을 많이 찾아보았지만 현재는 그러한 프로그램이 운영되지 않은 듯 하여 아쉽습니다. 그리고 괜찮으시다면 어떤 프로그램을 들었는지도 알 수 있을까요? 정말 감사합니다 :)
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