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[학술] Bioinformatics에 대해 질문드립니다.
회원작성글 PauWhao(대학원생)
  (2022-04-02 18:27)

Data science에 대한 관심이 급증하면서 Bioinformatics에 대한 관심도 같이 올라간 것 같습니다.

기술의 발달로 대규모의 생명 data를 얻을 수 있게 되었으며, -omics가 붙은 다양한 분야들이 

대세가 된 느낌을 받고 있습니다. 

저는 현재 암세포의 single-cell data를 가지고 여러 분석을 진행하여 유의미한 유전자를 찾는 등의 

연구를 진행하고 있으며 이를 Transcriptomic이라고 할 수 있는 것 같습니다.

 

Genomics: genome sequencing을 통해 DNA sequence를 확인할 수 있고 이를 분석하여 연구 진행

Transcriptomics: mRNA의 expression level을 확인하고 이를 분석하여 연구를 진행 

Proteomics: Protein level을 확인하고 이를 분석하여 연구를 진행 

이외에도 다양한 omics 분야들이 있을텐데 Bioinformatics을 활용한 분석이라 한다면

어떤 omics 분석이라고 볼 수 있을까요?

개인적으로 봤을때 NGS가 등장하기 전에는 DNA sequencing을 통한 genomics 위주,

NGS 이후에는 Transcriptomics 위주 (물론 Genomics도 여전히 중요), 만약 protein level의

측정 기술이 더욱 발전한다면 Proteomics로 의미가 옮겨갈 거 같습니다.

 

말이 길어졌는데 제가 궁금한 것은 

보통 'Bioinformatics를 활용한 연구를 하고 있다' 라고 한다면

어떤 Bioinformatics 기술을 가지고 연구를 하는 것인가요?

 

 

 



태그  #Bioinformatics
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  댓글 3  
회원작성글 해피쿠키(대학원생)  (2022-04-03 10:35)
1
개인적으로 느끼기엔 bioinformatics 라는 분야가 굉장히 broad하다고 생각해서요, 하나를 콕 찝어서 생각하지는 않는 것 같아요.. 그래도 굳이 대표를 꼽자면 human DNA쪽을 생각하지 않을까요?
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회원작성글 PPlP(대학원생)  (2022-04-04 17:54)
2
Bioinformatics의 의가 옮겨간다 라는 표현은 좀 이해가 안가네요. omics에만 한정되어 있는 것도 아니며, 또한 transcriptome, proteome 에만 국한되지도 않습니다.
샘플 분석 omics 에는 이외에도 ionome, metabolome 도 있습니다. 또한 최근에는 머신러닝을 이용하여 여러툴을 개발하고 있지요. 가장 유명한게 알파폴드, 로제타폴드 겠네요.
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회원작성글 병리초보(과기인)  (2022-04-05 15:00)
3
Bioinformatics를 활용한 연구를 하고 있다는 건, 님이 말한대로, 대규모 데이터 분석기술을 활용하여 (다양한 분야, 여기서는 본인의 연구분야)를 연구하고 있다는 것이죠. 그래서 정확하게 말하려면, Bioinformatics를 활용한 ( XXX; 거의 모든 연구분야가 다 들어갈 수 있습니다) 연구를 하고 있다' 라고 말해야 합니다.
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