소리마당 학술
단백질 구조 결정
초짜연구생 (대학원생)
단백질 구조학에 관련하여 PDB 데이터베이스를 공부를 하고 있는데 다음의 내용이 너무 이해가 안되서 질문드립니다. 혹시 알고 계신분은 설명 혹은 참고할만한 글을 알려주실수 있을까요? 부탁드립니다...
1) PDB의 저장 되어있는 단백질의 구조는 X-ray 결정학으로 대부분 밝혀졌다고 알고 있습니다.
이때 회절무늬의 좌표 및 강도를 기반으로 단백질의 구조를 컴퓨터로 계산한다고 알고있었고, 이때 전체의 구조를 한번에 계산하는 것으로 이해를 하고 넘어갔었습니다....
그런데 최근에 다시 보니까 asymetric unit 이걸 기반으로 symmetric operation을 적용하여 unit cell을 생성하고 unit cell을 복제해서 전체 structure을 밝힌다고하는데... 왜 이렇게 복잡하게 하는 건가요?
기껏 회절 무늬를 얻어 놓고서 왜 asymetric unit만 결정하고, 나머지는 컴퓨터로 계산해서 구조를 밝히는 건지가 잘 이해가 안되서 질문드립니다...
2) PDB에 보면 대칭 형태를 이루는 단백질도 존재하지만 6URI와 같이 전혀 대칭으로 보이지 않는 단백질의 구조도 있는데 이런 것들은 대체 어떻게 unit cell을 복제해서 예측이 가능한 건가요?
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