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[별별소리] protein identification에 꼭 standard protein이 필요한가요??
회원작성글 후_추(대학원생)
  (2020-06-02 11:13)

각각 다른 부위에서 채취한 시료에서 특정 단백질이 얼마나 들어있는지 함량을 정량분석하려고 하는데요.

저희 실험실이 단백질 연구에 관한 세팅이 되어있지 않아서 다른 곳에서 분석 의뢰를 맡기거나

제가 알아보고 교내 공동실험실습관에서 기기를 빌려쓰려고 합니다.

 

분석 맡길만한 곳을 알아보던 도중에 standard protein이 필요하다고 들었는데요.

이 양이 얼마나 필요한지 논문을 찾아보고 있는데 LC-MS를 이용해본 적이 없어서

찾는데 어려움이 있네요... ㅠㅠ

 

LC-MS로 단백질을 동정하고 정량화할 수 있다는 것은 알았는데

단백질을 동정할 때 reference로 이용하는 단백질은 어떻게 사용되는건가요?

제가 분석하려는 시료와 reference protein을 각각 다른 컬럼에 통과시켜서

같은 피크가 나오는 것을 동일한 단백질로 동정하는 것인가요?

 

사실 이 reference protein을 구하는 것도 문제인데, 어찌저찌 해서 구할만한 곳을 찾은 것 같습니다.

여기서 궁금한 것이 생겼는데. 같은 종류의 단백질로 분류되기는 하지만 프로틴 시퀀스가 80%정도만 같은 다른 종에서 유래한 프로틴을 reference protein으로 이용해도 되는걸까요??

이용한다면 양을 얼마나 써야할까요?

 



태그  #단백질 동정   #프로필린   #LC-MS
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