소리마당 학술
CRISPR/Cas9 screening 할 때 NGS로 analysis 를 해야 한다는데, 이 data를 어떻게 해석해야 하나요?
카리스마정 (대학생)
논문에서 아래와 같은 데이터를 보여주었습니다.
데이터는 sgRNA library 를 lentivirus 로 delivery 한 후, 약물 처리 하지 않거나 (Veh) or 처리하여 (PLX) 7일, 14일 후에 데이터를 비교한 것입니다.
우선 y 축이 무슨말인지 잘 모르겠더라구요.
sgRNA representation 이라는 건 아마도 sgRNA library 에 있는 무수히 많은 종류의 sgRNA 에 대한 걸 의미하는 것 같은데 (이 역시 제대로 이해했는지...), 괄호 안에 것은 무슨 말인지 모르겠고, y축의 숫자또한 무슨 말인지 전혀 모르겠습니다 ㅠㅠ 혹시 잘 아시는 분 있다면 알려주시면 정말 감사하겠습니다. 이번에 실험실을 옮기면서 그 쪽 교수님께서 오시기 전에 알고 오라고 준 논문인데 참 어렵네요..
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