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서울대학교 화학부 서세원 교수 (2)
"생명과학의 기초인 화학과의 융합을 위한 노력이 더 필요"

인터뷰 내용
 - 단백질 구조 연구를 위해 필요한 back ground
 - 공동연구를 제안하는 연구자들...
 - 구조 연구의 핵심기술과 어려운 점, 극복 방법
 - 구조유전체학은 운도 좋아야 한다?
 - 구조단백질체학 연구의 접근 방법과 예시
 - 구조를 밝힌 이후 기능 유추는?
 - 후배 연구자들에게 한마디
 - 화학과 생명과학의 융합학문 발전을 기대

일시: 2005년 8월 30일, 오후 2:00

장소: 서울대학교 생명과학관

서세원 교수 약력




실험실 동영상 보기

단백질 구조 연구를 post-doc. 과정동안 접근하려고 하면 어떤 back ground가 있어야 하나?

"post-doc. 과정에서 구조단백질체학 연구를 시작 하더라도 불가능한 것은 아니다. 그러나 결정학 지식이 뒷받침이 된다면 훨씬 연구에 접근이 쉽기 때문에 평소에 비전공자라도 물리화학과 구조생물학, 단백질 결정학 강의를 들어두면 좋다. 앞으로 단백질 구조분석은 생물학 연구를 위한 중요한 연구수단이 될 수 있기 때문에 단백질 구조를 직접 분석하지 않더라도 관심을 가지고 구조를 제대로 평가할 수 있는 능력을 갖추면 좋겠다.

공동연구를 제안하는 연구자들이 많을 것 같은데?

DNA polymerase나 lygase 같은 단백질은 90년대 초반 시작한 프로젝트였고 당시 구조 분석에만 4~5년 이상 걸렸다. 당시는 실험실이 잘 갖춰진 상황이 아니어서 유전자 cloning을 통한 단백질 생산은 공동연구에 의존을 했었다. 그러나 4~5년 전부터는 우리 실험실에서도 직접 단백질을 생산하고 있으며 현재 일년에 약 200여 종의 단백질을 cloning하고 있다. 그래서 함께 구조연구를 하고 싶어 하는 분들의 제안이 많지만 여력이 되지 않아 도와드리지 못하고 있다. 다른 훌륭한 연구자들이 국내 많이 계시기 때문에 그분들이 도움이 되어 줄 것이다."

단백질 구조 연구의 핵심기술과 어려움, 극복 방법

"단백질 생산 분야에서는 일본 Dr. Yokoyama, Dr. Endo가 개발한 Cell free protein expression 기술이 상당히 유망한 기술인데 현재 비용이 너무 비싸서 쉽게 사용할 수 없다는 단점을 가진다. 보통 대장균을 이용해서 세포내 단백질을 대량 생산하는데 이때 대장균이 이 단백질을 별로 좋아하지 않아 inclusion body 형태로 만들어버리는 경우가 많다. 그래서 단백질 생산에 필요한 여러 가지 요소들을 이용해서 세포 밖에서 만들어 이런 문제를 해결할 수 있다.

다른 방법은 단백질의 용해도를 높이기 위해 soluble mutant를 만드는 directed evolution 기술이다. 이 방법은 돈보다 노동력이 많이 드는 기술이다. 우리 실험실에서도 directed evolution 기술을 확보하고 결핵균 유전자 RV2002를 대장균에서 insoluble한 형태로 대량 발현하는데 성공했다."

구조유전체학은 운도 좋아야 한다?

"특히 결정을 만드는데 운이 많이 좌우한다. 내가 미국 UCLA에서 실험 할 때 아주 운 좋은 경험을 했다. 식물 광합성에서 CO2를 고정하는 단백질인 rubisco는 지구상에 가장 많은 단백질인데 나는 이 단백질의 활성화 상태에서 결정을 만드는 실험을 하고 있었다. 그러나 단백질 결정이 생기기도 하고 안 생기기도 해서 결정화가 종잡을 수 없었다.

기자: 장영옥
촬영/사진: 박지민
동영상 편집: 유숙희

  
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