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김영준
김영준 (Young-Joon Kim) 저자 이메일 보기
연세대학교
 
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Intrinsic variability of gene expression encoded in nucleosome positioning sequences
Jung Kyoon Choi1 & Young-Joon Kim1

Variation in gene expression is an essential material for biological diversity among single cells1, 2, 3, individuals4, 5, 6 and populations or species7, 8, 9. Here we show that expression variability is an intrinsic property that persists at those different levels. Each promoter seems to have a unique capacity to respond to external signals that can be environmental, genetic or even stochastic. Our investigation into nucleosome organization of variably responding promoters revealed a commonly positioned nucleosome at a critical regulatory region where most transcription start sites and TATA elements are located, a deviation from typical nucleosome-free status. The nucleotide sequences in this region of variable promoters showed a high propensity for DNA bending and a periodic distribution of particular dinucleotides, encoding preferences for DNA-nucleosome interaction. Variable expression is likely to occur during removal of this nucleosome for gene activation. This is a unique example of how promoter sequences intrinsically encode regulatory flexibility, which is vital for biological processes such as adaptation, development and evolution.

1. Department of Biochemistry, Yonsei University, Seodaemun-gu, Seoul, Korea.

Correspondence to: Young-Joon Kim1

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2009년 03월 (BRIC 등록일 2009-03-03)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Genetics
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