[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 한국을 빛내는 사람들
2019 Bio Top5 인터뷰
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2
전체보기 한빛사논문 추천논문 인터뷰 그이후 한빛사통계
강효진
강효진 (Hyojin Kang) 저자 이메일 보기
KAIST
  인터뷰보기 
조회 5098  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Genome-Wide Analysis of Genes Targeted by PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR 3-LIKE5 during Seed Germination in Arabidopsis
Eunkyoo Oh 1, Hyojin Kang 2, Shinjiro Yamaguchi 3, Jeongmoo Park 1, Doheon Lee 2, Yuji Kamiya 3, and Giltsu Choi 1*

1 Department of Biological Sciences, KAIST, Daejeon 305-701, Korea
2 Department of Bio and Brain Engineering, KAIST, Daejeon 305-701, Korea
3 RIKEN Plant Science Center, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan

* To whom correspondence should be addressed.

PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR 3-LIKE5 (PIL5) is a basic helix-loop-helix transcription factor that inhibits seed germination by regulating the expression of gibberellin (GA)- and abscisic acid (ABA)-related genes either directly or indirectly. It is not yet known, however, whether PIL5 regulates seed germination solely through GA and ABA. Here, we used Chromatin immunoprecipitation-chip (ChIP-chip) analysis to identify 748 novel PIL5 binding sites in the Arabidopsis thaliana genome. Consistent with the molecular function of PIL5 as a transcription regulator, most of the identified binding sites are located in gene promoter regions. Binding site analysis shows that PIL5 binds to its target sites mainly through the G-box motif in vivo. Microarray analysis reveals that phytochromes regulate a large number of genes mainly through PIL5 during seed germination. Comparison between the ChIP-chip and microarray data indicates that PIL5 regulates 166 genes by directly binding to their promoters. Many of the identified genes encode transcription regulators involved in hormone signaling, while some encode enzymes involved in cell wall modification. Interestingly, PIL5 directly regulates many transcription regulators of hormone signaling and indirectly regulates many genes involved in hormone metabolism. Taken together, our data indicate that PIL5 inhibits seed germination not just through GA and ABA, but also by coordinating hormone signals and modulating cell wall properties in imbibed seeds.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2009년 02월 (BRIC 등록일 2014-12-09)
- 연구진: 국내(교신)+국외 연구진태극기
- 분야: Plant Science, Biochemistry, Cell_Biology
- 피인용횟수: 120회 이상 인용된 논문
관련 인터뷰
1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명 식물에게 종자의 발아과정은 이후의 생장과 번식의 성공여부를 결정짓는 중요한 순간입니다. 종자는 온도, 빛, 수분과 같은 다양한 외부 환경정보를 감지하고 있다가, 최적의 순간이 오면 호르몬 신호를 통해 종자발아를 시작합니다. 많은 식물에 있어 종자발아는 빛 신호를 통한 지베렐린(gibberellin)과 앱식산(abscisic acid) 두 호르몬의 상호작용에 의해 조절됩니다. 지베렐린은 종자발아를 촉진시키는데 반해...
유전자 편집 기술을 활용한 도시농업 적합 작물 개발[Nat. Biotechnol.]
권춘탁
발표: 권춘탁 (Cold Spring Harbor Labor...)
일자: 2020년 2월 19일 (수) 오전 11시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
동물의 육감: 자기감각(Magnetic Sense) [PNAS]
채권석
발표: 채권석 (경북대학교)
일자: 2020년 2월 6일 (목) 오후 02시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
영장류의 실시간 미래 예측과 신경적 기작[Nat. Neurosci.]
유승범
발표: 유승범 (University of Minnesota)
일자: 2020년 2월 12일 (수) 오전 10시 (한국시간)
언어: 영어
참석자 접수신청하기

  댓글 0
등록
 
목록
데일리파트너스
관련링크
강효진 님 전체논문보기 >
관련인물
김정현 (KAIST)
박정무 (Duke University...)
오은규 (고려대학교)
최길주 (KAIST)
관련분야 논문보기
Plant Science

Biochemistry

Biochemistry

외부링크
Google (by Hyojin Kang)
Pubmed (by Hyojin Kang)
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
[BRIC Webinar]동물의 육감: 자기감각(Magnetic Sense) [PNAS]
[BRIC Webinar]동물의 육감: 자기감각(Magnetic Sense) [PNAS]
사전접수: ~2020.02.05
날짜: 2020.02.06
Online 개최
2020 서경배과학재단 신진과학자 연구지원 프로그램
2020 서경배과학재단 신진과학자 연구지원 프로그램
날짜: 2020.03.31
주관: 서경배과학재단
[무료/ 취업연계]바이오QC 실무과정 8기 모집
[무료/ 취업연계]바이오QC 실무과정 8기 모집
사전접수: ~2020.02.10
날짜: 2020.03.02~06.12
장소: 성남시 분당구 황새울로
위로가기
한빛사 홈  |  한빛사FAQ  |  한빛사 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS