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화찬웅
화찬웅 (Chanwoong Hwa) 저자 이메일 보기
고려대학교
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Augmentation of the RNA m6A reader signature is associated with poor survival by enhancing cell proliferation and EMT across cancer types
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Abstract

N6-Methyladenosine (m6A) RNA modification plays a critical role in the posttranscriptional regulation of gene expression. Alterations in cellular m6A levels and m6A-related genes have been reported in many cancers, but whether they play oncogenic or tumor-suppressive roles is inconsistent across cancer types. We investigated common features of alterations in m6A modification and m6A-related genes during carcinogenesis by analyzing transcriptome data of 11 solid tumors from The Cancer Genome Atlas database and our in-house gastric cancer cohort. We calculated m6A writer (W), eraser (E), and reader (R) signatures based on corresponding gene expression. Alterations in the W and E signatures varied according to the cancer type, with a strong positive correlation between the W and E signatures in all types. When the patients were divided according to m6A levels estimated by the ratio of the W and E signatures, the prognostic effect of m6A was inconsistent according to the cancer type. The R and especially the R2 signatures (based on the expression of IGF2BPs) were upregulated in all cancers. Patients with a high R2 signature exhibited poor prognosis across types, which was attributed to enrichment of cell cycle- and epithelial–mesenchymal transition-related pathways. Our study demonstrates common features of m6A alterations across cancer types and suggests that targeting m6A R proteins is a promising strategy for cancer treatment.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2022년 07월 (BRIC 등록일 2022-08-09)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Genomics, Cancer Biology/Oncology, Bioinformatics
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