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이원철
이원철 (Won-Chul Lee) 저자 이메일 보기
University of Texas MD Anderson Cancer Center, Pfizer, Inc.
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207 KB
  CV updated 2020-11-07 02:45
 
조회 358  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Multiomics profiling of primary lung cancers and distant metastases reveals immunosuppression as a common characteristic of tumor cells with metastatic plasticity
열기 Authors and Affiliations

Abstract

Background
Metastasis is the primary cause of cancer mortality accounting for 90% of cancer deaths. Our understanding of the molecular mechanisms driving metastasis is rudimentary.

Results
We perform whole exome sequencing (WES), RNA sequencing, methylation microarray, and immunohistochemistry (IHC) on 8 pairs of non-small cell lung cancer (NSCLC) primary tumors and matched distant metastases. Furthermore, we analyze published WES data from 35 primary NSCLC and metastasis pairs, and transcriptomic data from 4 autopsy cases with metastatic NSCLC and one metastatic lung cancer mouse model. The majority of somatic mutations are shared between primary tumors and paired distant metastases although mutational signatures suggest different mutagenesis processes in play before and after metastatic spread. Subclonal analysis reveals evidence of monoclonal seeding in 41 of 42 patients. Pathway analysis of transcriptomic data reveals that downregulated pathways in metastases are mainly immune-related. Further deconvolution analysis reveals significantly lower infiltration of various immune cell types in metastases with the exception of CD4+ T cells and M2 macrophages. These results are in line with lower densities of immune cells and higher CD4/CD8 ratios in metastases shown by IHC. Analysis of transcriptomic data from autopsy cases and animal models confirms that immunosuppression is also present in extracranial metastases. Significantly higher somatic copy number aberration and allelic imbalance burdens are identified in metastases.

Conclusions
Metastasis is a molecularly late event, and immunosuppression driven by different molecular events, including somatic copy number aberration, may be a common characteristic of tumors with metastatic plasticity.

논문정보
- 형식: Research article
- 게재일: 2020년 11월 (BRIC 등록일 2020-11-06)
- 연구진: 국외연구진
- 분야: Genomics, Cancer Biology/Oncology, Bioinformatics
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