[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보 회원가입   로그인
BRIC홈 한국을 빛내는 사람들
필코리아테크놀로지
배너광고안내
이전
다음
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
BioLab 신동혁 교수
전체보기 추천논문 상위피인용논문 인터뷰 그이후 한빛사통계
공정호
공정호 (JungHo Kong) 저자 이메일 보기
POSTECH
저자CV 보기
281 KB
  CV updated 2022-06-30 07:36
  인터뷰보기 
조회 1463  인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
Network-based machine learning in colorectal and bladder organoid models predicts anti-cancer drug efficacy in patients
열기 Authors and Affiliations

Abstract

Cancer patient classification using predictive biomarkers for anti-cancer drug responses is essential for improving therapeutic outcomes. However, current machine-learning-based predictions of drug response often fail to identify robust translational biomarkers from preclinical models. Here, we present a machine-learning framework to identify robust drug biomarkers by taking advantage of network-based analyses using pharmacogenomic data derived from three-dimensional organoid culture models. The biomarkers identified by our approach accurately predict the drug responses of 114 colorectal cancer patients treated with 5-fluorouracil and 77 bladder cancer patients treated with cisplatin. We further confirm our biomarkers using external transcriptomic datasets of drug-sensitive and -resistant isogenic cancer cell lines. Finally, concordance analysis between the transcriptomic biomarkers and independent somatic mutation-based biomarkers further validate our method. This work presents a method to predict cancer patient drug responses using pharmacogenomic data derived from organoid models by combining the application of gene modules and network-based approaches.

논문정보
TOP5
2020년 후보
- 형식: Research article
- 게재일: 2020년 10월 (BRIC 등록일 2020-11-02)
- 연구진: 국내연구진태극기
- 분야: Genetics, Bioinformatics, Cancer Biology/Oncology
관련 인터뷰
1. 논문관련 분야의 소개, 동향, 전망을 설명, 연구과정에서 생긴 에피소드 같은 암을 앓는 환자라도 항암제의 효과가 매우 다르게 나타나기 때문에, 항암제의 효과를 미리 알 수 있는 기술이 매우 중요한 상황입니다. 이를 위해, 기계 학습 모델을 이용하여 환자의 전사체 정보를 토대로 항암제의 효과를 예측하려는 노력들이 진행되고 있습니다. 하지만, 기존의 기계 학습 모델들은 상대적으로 확보하기 쉬운 동물 모델을 주로 이용하였는데, 환자와 동물간의 생물학적 차이...
관련 보도자료
항암제 치료효과 예측하는 머신러닝 기술 개발
약물유전체학의 등장으로 기존에 축적된 다양한 약물반응데이터를 토대로 자체적인 알고리즘을 도출, 사람마다 다른 약물 반응성을 예측하는 머신러닝 연구가 활발하다. 사람의 생체반응을 최대한 반영할 수 있는 양질의 학...
ADAM10을 통한 프리온 단백질 돌연변이 특이적 세포 외 방출 [Redox Biol.]
신예진
발표: 신예진 (울산대학교 의과대학, 서울아산병원)
일자: 2022년 12월 2일 (금) 오후 02시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
면역시스템(NF-κB signaling pathway)의 세포외신호 처리능력 규명[Sci. Adv.]
손민준
발표: 손민준 (University of Chicago)
일자: 2022년 12월 7일 (수) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
Co-methylation 네트워크를 이용한 알츠하이머병 병리 연관 멀티오믹스 (후성유전체, 전사체) 분석 연구[Biol. Psychiatry]
김준표
발표: 김준표 (Indiana University)
일자: 2022년 12월 9일 (금) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
편도체로 다중감각 위협 정보를 전달하는 중앙경보시스템에 대한 연구 [Cell Reports]
강석재
발표: 강석재 (Salk Institute for Biolo...)
일자: 2022년 12월 14일 (수) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
그래프 딥러닝을 활용한 암 병리 이미지 분석을 통한 암 환자 생존률 예측 및 암 미세환경 마커 발굴[Nat. Biomed. Eng.]
이용주
발표: 이용주 (서울대학교)
일자: 2022년 12월 15일 (목) 오후 03시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
2,3-부탄디올 생산을 위한 효모 대사선의 재배치와 두가지 다운스트림 응용: 메틸 에틸 케톤 및 농업 생물 촉진제 생산의 기술 경제적 분석 및 전과정 평가 [Chem. Eng. J.]
이재원
발표: 이재원 (University of Illinois,...)
일자: 2022년 12월 19일 (월) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
인슐린 수용체-압타머 결합 구조를 통해 밝혀진 인슐린 수용체의 선택적 활성화 기작 [Nat. Commun.]
윤나오
발표: 윤나오 (POSTECH)
일자: 2022년 12월 19일 (월) 오후 02시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
TET 단백질에 의한 지방세포 열생산 조절기전 연구 [Proc. Natl. Acad. Sci. USA.]
변성준
발표: 변성준 (울산과학기술원)
일자: 2022년 12월 22일 (목) 오전 11시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
필수 아미노산 트레오닌의 식이제한 모사 건강 장수 효능 기전 [Nat. Commun.]
김주원
발표: 김주원 (아모레퍼시픽기술연구원)
일자: 2022년 12월 27일 (화) 오전 10시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기
Mitoguardin-2를 매개로하는 소포체-미토콘드리아 막접촉점 사이에서의 인지질 수송 [Nat. Commun.]
김현우
발표: 김현우 (UNIST)
일자: 2022년 12월 27일 (화) 오후 03시 (한국시간)
언어: 한국어
참석자 접수신청하기

  댓글 0
등록
 
목록
관련링크
공정호 님 전체논문보기 >
관련인물
관련분야 논문보기
Genetics

Bioinformatics

Cancer Biology/Oncology

외부링크
ORCID ORCID 0000-0002-3532-3163
Google Scholar
PubMed
프리미엄 Bio일정 Bio일정 프리미엄 안내
[싸이티바 웨비나] 공정 개발을 위한 자동화 올리고뉴클레오타이드 합성 전략
In vivo specific imaging technique : Chamber & Windows Application in animal model
바이오QC 실무과정 14기 모집
바이오QC 실무과정 14기 모집
사전접수: ~2022.12.09
날짜: 2022.11.14~12.09
장소: 경기 성남시 분당구 황새울로 329번길 5
2022 바이오·제약 인천 글로벌 콘펙스
2022 바이오·제약 인천 글로벌 콘펙스
사전접수: ~2022.11.29
날짜: 2022.11.30~12.02
장소: 송도컨벤시아
[싸이티바] 2023 바이오 트렌드 서밋 - With you from discovery to delivery
[싸이티바] 2023 바이오 트렌드 서밋 - With you from discovery to delivery
사전접수: ~2022.11.15
날짜: 2022.11.16~17
장소: 그래비티 호텔 판교 B1 스페이스 볼룸
[전액무료]11월/12월 재직자 대상 직무능력 향상교육 참여 교육생 모집(의약품ㆍ화장품ㆍ분석기기 활용)
[전액무료]11월/12월 재직자 대상 직무능력 향상교육 참여 교육생 모집(의약품ㆍ화장품ㆍ분석기기 활용)
날짜: 2022.10.17~12.16
장소: 충북 청주시 흥덕구 오송생명1로 194-25, 청주SB플라자
위로가기
한빛사 홈  |  한빛사FAQ
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
에펜도르프코리아 광고